More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2209 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  66.95 
 
 
124 aa  172  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  62.28 
 
 
126 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  60.18 
 
 
126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.66 
 
 
125 aa  151  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.52 
 
 
126 aa  151  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  58.56 
 
 
134 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  54.78 
 
 
126 aa  148  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  54.78 
 
 
126 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.56 
 
 
119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  55.86 
 
 
134 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.72 
 
 
123 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  53.04 
 
 
134 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  55.36 
 
 
134 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  52.68 
 
 
134 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.7 
 
 
130 aa  140  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  53.15 
 
 
134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  52.68 
 
 
130 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.29 
 
 
141 aa  133  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  51.33 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  50 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  49.56 
 
 
126 aa  126  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  49.56 
 
 
168 aa  126  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  51.33 
 
 
126 aa  126  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  48.21 
 
 
130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  48.21 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.96 
 
 
119 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.02 
 
 
123 aa  113  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  49.06 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  44.86 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  45.87 
 
 
121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  44.55 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.55 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  44.34 
 
 
126 aa  107  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  47.83 
 
 
119 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.64 
 
 
118 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1045  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
110 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
107 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
109 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  45.28 
 
 
107 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  42.45 
 
 
107 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.35 
 
 
113 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  42.45 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  42.45 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  38.89 
 
 
110 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2144  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253252  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.96 
 
 
110 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2179  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00700081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.96 
 
 
110 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4610  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0799177  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  42.45 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.12 
 
 
123 aa  97.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1859  HesB/YadR/YfhF  45.05 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  41.51 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.68 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  41.51 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  41.51 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  41.51 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.35 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>