More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0620 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
110 aa  225  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
110 aa  225  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  97.27 
 
 
110 aa  221  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  87.04 
 
 
109 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  49.06 
 
 
126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  49.06 
 
 
126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  46.3 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  46.3 
 
 
130 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
126 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  49.52 
 
 
126 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  48.11 
 
 
126 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  44.44 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  45.28 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  49.07 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  48.11 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.6 
 
 
107 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.66 
 
 
107 aa  107  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  48.6 
 
 
107 aa  107  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
125 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
130 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  44.14 
 
 
113 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  43.12 
 
 
242 aa  105  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  46.73 
 
 
141 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
111 aa  104  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  46.67 
 
 
118 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
120 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  45.28 
 
 
128 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  47.17 
 
 
121 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.11 
 
 
107 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  41.51 
 
 
134 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  45.28 
 
 
117 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.11 
 
 
107 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.67 
 
 
123 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  41.51 
 
 
134 aa  103  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  41.51 
 
 
134 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  46.73 
 
 
107 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.73 
 
 
107 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
118 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  44.86 
 
 
107 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  43.4 
 
 
134 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
107 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  39.81 
 
 
130 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.73 
 
 
122 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.73 
 
 
107 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  46.23 
 
 
106 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
118 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  44.44 
 
 
126 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.95 
 
 
118 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  44.44 
 
 
168 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.73 
 
 
107 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
108 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
119 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
115 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  42.45 
 
 
134 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
115 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
106 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
123 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
106 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.73 
 
 
141 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  45.79 
 
 
107 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  46.73 
 
 
107 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  44.04 
 
 
111 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  43.93 
 
 
107 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.62 
 
 
107 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2494  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.176727 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  41.12 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  39.62 
 
 
134 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  44.86 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2452  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
121 aa  99  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  43.52 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  44.55 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  44.55 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  44.55 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.95 
 
 
113 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  44.55 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.36 
 
 
109 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.96 
 
 
119 aa  98.2  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
106 aa  98.2  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  42.99 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>