More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3257 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
119 aa  244  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  61.54 
 
 
134 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.17 
 
 
123 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  60.68 
 
 
134 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  59.83 
 
 
134 aa  163  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  60.68 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  60.68 
 
 
134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  59.83 
 
 
134 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  64.86 
 
 
126 aa  157  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.48 
 
 
130 aa  156  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  63.06 
 
 
126 aa  154  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  65.77 
 
 
126 aa  154  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.61 
 
 
125 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  65.45 
 
 
126 aa  153  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  65.45 
 
 
126 aa  153  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.56 
 
 
119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.39 
 
 
141 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.77 
 
 
119 aa  140  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.01 
 
 
124 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  54.55 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  54.55 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  54.55 
 
 
168 aa  127  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  49.56 
 
 
128 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
118 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
118 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  51.35 
 
 
126 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  50 
 
 
121 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.33 
 
 
123 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  51.4 
 
 
107 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  50.88 
 
 
117 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  48.6 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  45.95 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  46.85 
 
 
130 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.73 
 
 
107 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  52.34 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  52.34 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  46.85 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50.47 
 
 
107 aa  117  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  51.4 
 
 
107 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50.47 
 
 
107 aa  115  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  46.85 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_002978  WD0890  HesB/YadR/YfhF family protein  42.4 
 
 
137 aa  114  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.046995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
115 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
115 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.66 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1045  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.36 
 
 
110 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  48.6 
 
 
107 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2179  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.53 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00700081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  48.11 
 
 
106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  46.73 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.11 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0631  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.27 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.73 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  46.73 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.86 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.11 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  46.73 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.66 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  45.22 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
106 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.93 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
106 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2144  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.6 
 
 
107 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  48.6 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
107 aa  110  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  44.86 
 
 
107 aa  110  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.73 
 
 
107 aa  110  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2869  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.6 
 
 
107 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.586009  hitchhiker  0.0000000184682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
106 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  42.99 
 
 
107 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  43.93 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  42.99 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.52 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
107 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.86 
 
 
107 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
109 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  44.86 
 
 
107 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
109 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
107 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
107 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
109 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  44.86 
 
 
109 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  44.64 
 
 
242 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  42.99 
 
 
107 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  50.91 
 
 
119 aa  107  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>