More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2323 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
134 aa  276  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  93.28 
 
 
134 aa  262  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  80.6 
 
 
134 aa  234  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  78.52 
 
 
134 aa  228  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  77.61 
 
 
134 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  85.71 
 
 
123 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  81.51 
 
 
134 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.68 
 
 
119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  64.29 
 
 
126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  62.5 
 
 
126 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  62.28 
 
 
125 aa  158  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.61 
 
 
126 aa  155  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.87 
 
 
130 aa  155  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  61.82 
 
 
126 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  61.82 
 
 
126 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.03 
 
 
141 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.15 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  54.39 
 
 
126 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  54.46 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  54.39 
 
 
168 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  53.91 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  52.68 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  50 
 
 
130 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  50.44 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.65 
 
 
124 aa  126  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  50.89 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.86 
 
 
119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.96 
 
 
118 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  45.95 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  44.88 
 
 
242 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  46.09 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  46.09 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.09 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  46.36 
 
 
113 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  46.85 
 
 
117 aa  110  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  46.73 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  46.23 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.53 
 
 
123 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  45.28 
 
 
107 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.6 
 
 
106 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.9 
 
 
126 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.6 
 
 
106 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  42.45 
 
 
110 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
110 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
110 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.6 
 
 
107 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  48.6 
 
 
106 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  46.15 
 
 
107 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  44.34 
 
 
107 aa  103  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  43.4 
 
 
107 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  43.4 
 
 
107 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0631  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.89 
 
 
147 aa  103  9e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
107 aa  102  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
108 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.32 
 
 
126 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  43.4 
 
 
107 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
109 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
123 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  44.34 
 
 
107 aa  100  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  43.81 
 
 
107 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0890  HesB/YadR/YfhF family protein  37.9 
 
 
137 aa  100  8e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.046995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.08 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  41.9 
 
 
141 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1045  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.12 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  39.09 
 
 
119 aa  99  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
115 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.8 
 
 
122 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
115 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.15 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.12 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2179  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.62 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00700081  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.15 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  48.57 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
111 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  38.68 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
113 aa  97.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  46.67 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
118 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0201  HesB/YadR/YfhF  37.5 
 
 
120 aa  96.7  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.28 
 
 
111 aa  96.7  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>