More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3315 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
126 aa  262  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  71.68 
 
 
123 aa  176  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.28 
 
 
141 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  44.88 
 
 
134 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  46.15 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  47.71 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  47.71 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.79 
 
 
126 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.13 
 
 
123 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  43.9 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  47.79 
 
 
113 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  40.83 
 
 
134 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  48.57 
 
 
107 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  45.79 
 
 
126 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  43.85 
 
 
242 aa  105  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  43.9 
 
 
134 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  48.57 
 
 
107 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.95 
 
 
119 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  43.86 
 
 
119 aa  103  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2740  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  48.57 
 
 
107 aa  102  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
109 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  45.71 
 
 
107 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
109 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
109 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
109 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.86 
 
 
119 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
124 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  42.99 
 
 
126 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  44.76 
 
 
107 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
107 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
106 aa  101  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
107 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
107 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  49.52 
 
 
107 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  46.67 
 
 
107 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1479  HesB/YadR/YfhF family protein  43.4 
 
 
106 aa  101  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
106 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  41.96 
 
 
134 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  49.55 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  44.76 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  43.81 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  46.67 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  42.86 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  43.81 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  43.81 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  43.81 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.76 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  42.99 
 
 
130 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_002978  WD0890  HesB/YadR/YfhF family protein  38.66 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.046995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0201  HesB/YadR/YfhF  40.68 
 
 
120 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  42.86 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  42.86 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.71 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  39.62 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  42.86 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.37 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.76 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  40 
 
 
107 aa  94  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  39.62 
 
 
128 aa  94  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
106 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
111 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  41.9 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.76 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4552  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.685133  normal  0.324174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  40.95 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.98 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.76 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  48.24 
 
 
107 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>