More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4552 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4552  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
138 aa  275  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.685133  normal  0.324174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.87 
 
 
108 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
123 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.12 
 
 
109 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.24 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
141 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.24 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  40.95 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.66 
 
 
127 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
121 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.66 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  42.34 
 
 
127 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  40.95 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  44.76 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  40 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  46.67 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
120 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  40 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.53 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
106 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  41.9 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  42.86 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  42.86 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  42.86 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  42.86 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0167  hesB/yadR/yfhF family protein  40 
 
 
117 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  40 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.19 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2740  iron-sulfur cluster assembly protein  42.86 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.45 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  40 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  40 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  40 
 
 
130 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  94.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  40.95 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  40 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  40 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  39.05 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  40 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.68 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  40 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  39.05 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.1 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.24 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  41.9 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  38.1 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  42.59 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  38.1 
 
 
107 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  38.1 
 
 
107 aa  94  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  38.1 
 
 
107 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  40 
 
 
130 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  42.99 
 
 
118 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  47.56 
 
 
110 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  40 
 
 
107 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  94  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  41.51 
 
 
106 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2869  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.14 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.586009  hitchhiker  0.0000000184682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
106 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
106 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
106 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
107 aa  93.2  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  93.2  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  93.2  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  93.2  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  93.2  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  93.2  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26221  hypothetical protein  41.96 
 
 
130 aa  93.2  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.49947 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  93.2  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  93.2  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>