More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0765 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
117 aa  243  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  79.82 
 
 
126 aa  193  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  75.21 
 
 
118 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  74.36 
 
 
118 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  74.36 
 
 
118 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  76.11 
 
 
121 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  68.14 
 
 
123 aa  163  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  50 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.57 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  50.93 
 
 
128 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  52.83 
 
 
126 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  51.89 
 
 
126 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.82 
 
 
125 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.88 
 
 
119 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  52.83 
 
 
168 aa  120  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  50.47 
 
 
130 aa  120  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  49.53 
 
 
130 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  50.93 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  47.83 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  48.6 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.91 
 
 
126 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.37 
 
 
123 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  50.93 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  50.93 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  49.07 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.94 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  46.85 
 
 
134 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  46.85 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  50.47 
 
 
119 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
124 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  46.85 
 
 
134 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  45.05 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  45.95 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  45.79 
 
 
242 aa  104  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
110 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
110 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
106 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
109 aa  103  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  44.44 
 
 
111 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.76 
 
 
107 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.76 
 
 
107 aa  103  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 
113 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  41.9 
 
 
107 aa  103  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  44.34 
 
 
110 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
107 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.76 
 
 
107 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  43.81 
 
 
107 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.52 
 
 
118 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.71 
 
 
107 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.44 
 
 
115 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.44 
 
 
115 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  46.67 
 
 
107 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  43.81 
 
 
107 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  44.76 
 
 
107 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.52 
 
 
122 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  100  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.23 
 
 
107 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  43.81 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.37 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.55 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  44.23 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  43.81 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  41.9 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  43.81 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  43.81 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  43.27 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.59 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  42.06 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  42.86 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.52 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2179  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.76 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00700081  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.52 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>