More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1894 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  100 
 
 
130 aa  269  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  95.38 
 
 
130 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  84.8 
 
 
128 aa  223  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  80.33 
 
 
130 aa  211  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  72.36 
 
 
128 aa  183  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  70.54 
 
 
126 aa  166  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  68.38 
 
 
168 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  68.75 
 
 
126 aa  160  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55 
 
 
126 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  54.62 
 
 
126 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  53.85 
 
 
126 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  56.76 
 
 
119 aa  134  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  52.94 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  52.94 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.07 
 
 
125 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  52.68 
 
 
134 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  51.79 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.79 
 
 
123 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  47.32 
 
 
134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.21 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
134 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
134 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
124 aa  124  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  48.21 
 
 
134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.85 
 
 
119 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  45.61 
 
 
118 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  45.38 
 
 
126 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  49.53 
 
 
117 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.74 
 
 
118 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.61 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.74 
 
 
118 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.27 
 
 
130 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  46.3 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  46.02 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.15 
 
 
119 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.69 
 
 
123 aa  107  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.75 
 
 
119 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.75 
 
 
119 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  40.57 
 
 
107 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  38.32 
 
 
113 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  39.62 
 
 
107 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  41.51 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.72 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  39.62 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
107 aa  95.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.72 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.42 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
106 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1479  HesB/YadR/YfhF family protein  39.42 
 
 
106 aa  94  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  37.74 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2740  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.78 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  39.62 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  42.2 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  42.2 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  42.2 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  39.62 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  41.75 
 
 
107 aa  92.8  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  42.2 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.86 
 
 
107 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0201  HesB/YadR/YfhF  39.05 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.86 
 
 
107 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.32 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  36.19 
 
 
119 aa  91.3  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  37.14 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
113 aa  90.5  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.89 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  36.79 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.74 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  36.19 
 
 
242 aa  90.1  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4610  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0799177  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>