More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2442 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  100 
 
 
128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  84.8 
 
 
130 aa  223  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  84.68 
 
 
130 aa  221  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  75.4 
 
 
130 aa  201  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  72.95 
 
 
128 aa  184  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  67.77 
 
 
126 aa  165  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  67.77 
 
 
168 aa  165  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  65.04 
 
 
126 aa  160  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  54.46 
 
 
126 aa  133  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  54.46 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.94 
 
 
126 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
118 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  58.56 
 
 
119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  48.74 
 
 
126 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  50.89 
 
 
134 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
124 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  54.13 
 
 
126 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.89 
 
 
123 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  54.13 
 
 
126 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.12 
 
 
118 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  46.43 
 
 
134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  50.89 
 
 
134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.93 
 
 
125 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  49.11 
 
 
134 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  49.56 
 
 
121 aa  120  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
130 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  46.43 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  47.32 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.85 
 
 
119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.61 
 
 
141 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.27 
 
 
123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  44.44 
 
 
110 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.44 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.44 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  40.19 
 
 
113 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
111 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.78 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.78 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  39.62 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  41.75 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.25 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1479  HesB/YadR/YfhF family protein  41.35 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.75 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0201  HesB/YadR/YfhF  39.05 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.75 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  40.57 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  39.62 
 
 
107 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.46 
 
 
106 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.72 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  40.57 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  38.68 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.78 
 
 
107 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.75 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  92  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
109 aa  92  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
109 aa  92  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
109 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
107 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  40.57 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  39.62 
 
 
107 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  39.62 
 
 
109 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.61 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  40.38 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  38.68 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1512  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  41.75 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613929  hitchhiker  0.00000225321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  40.78 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2398  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  41.75 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00029716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1958  FeS assembly scaffold SufA  41.35 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1900  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  41.35 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00343676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  41.03 
 
 
123 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1694  FeS assembly scaffold SufA  37.74 
 
 
124 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.894129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1765  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  41.35 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.718916  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  38.68 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  38.68 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  38.68 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  38.68 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  38.68 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1885  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  41.35 
 
 
122 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0466  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.93 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0234938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.32 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  40.78 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>