More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4614 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
141 aa  286  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  57.81 
 
 
134 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  58.59 
 
 
134 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  58.27 
 
 
134 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  57.03 
 
 
134 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  65.77 
 
 
126 aa  153  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  65.77 
 
 
126 aa  153  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  65.14 
 
 
126 aa  153  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.53 
 
 
123 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  60.5 
 
 
126 aa  151  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.55 
 
 
125 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  52.34 
 
 
134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.86 
 
 
126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  55.08 
 
 
134 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.39 
 
 
119 aa  141  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.78 
 
 
130 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.13 
 
 
124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.29 
 
 
119 aa  133  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.72 
 
 
119 aa  133  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.57 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  53.1 
 
 
128 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  47.5 
 
 
168 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.28 
 
 
126 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  49.58 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  50.93 
 
 
126 aa  124  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  43.85 
 
 
242 aa  123  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  51.89 
 
 
126 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  46.61 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  46.61 
 
 
128 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  44.92 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  43.75 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  38.98 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  42.74 
 
 
126 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  42.86 
 
 
107 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  43.81 
 
 
107 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  43.81 
 
 
107 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  42.86 
 
 
107 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  43.81 
 
 
107 aa  104  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  104  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
113 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2849  HesB/YadR/YfhF  47.62 
 
 
108 aa  103  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04050  iron ion transport-related protein, putative  42.2 
 
 
215 aa  103  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  43.4 
 
 
106 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
106 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
106 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.25 
 
 
123 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.69 
 
 
118 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
107 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  40 
 
 
107 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  43.69 
 
 
118 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.69 
 
 
118 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
108 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
118 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
115 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
111 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
115 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2349  putative iron-binding protein iscA  45.63 
 
 
121 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0909785  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
122 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.73 
 
 
110 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.73 
 
 
110 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  40 
 
 
107 aa  100  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
106 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  41.9 
 
 
107 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  41.9 
 
 
107 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  44.76 
 
 
107 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.76 
 
 
107 aa  100  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  44.76 
 
 
107 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  44.76 
 
 
107 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  44.76 
 
 
109 aa  100  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  44.76 
 
 
109 aa  100  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  44.76 
 
 
109 aa  100  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  44.76 
 
 
107 aa  100  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  44.76 
 
 
109 aa  100  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  38.1 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  40 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  41.82 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  42.61 
 
 
119 aa  99.4  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  43.81 
 
 
107 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>