More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2568 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
113 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  52.34 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.4 
 
 
125 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  50.47 
 
 
126 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.34 
 
 
126 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  50.91 
 
 
134 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  51.4 
 
 
126 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  51.4 
 
 
126 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
123 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.45 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.45 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  46.36 
 
 
134 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  46.36 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  46.36 
 
 
134 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  45.45 
 
 
134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.22 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  46.36 
 
 
134 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.75 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  48.6 
 
 
242 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.79 
 
 
126 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  46.73 
 
 
119 aa  107  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  45.05 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.14 
 
 
110 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.14 
 
 
110 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0631  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.34 
 
 
147 aa  104  5e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.45 
 
 
119 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_002978  WD0890  HesB/YadR/YfhF family protein  46.22 
 
 
137 aa  103  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.046995  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  40.19 
 
 
128 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
108 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04050  iron ion transport-related protein, putative  42.99 
 
 
215 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0201  HesB/YadR/YfhF  42.73 
 
 
120 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.93 
 
 
109 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_9276  predicted protein  44.44 
 
 
110 aa  101  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0369403  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0408  HesB/YadR/YfhF  40.54 
 
 
141 aa  100  6e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  38.32 
 
 
130 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0667  HesB/YadR/YfhF  42.73 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0115559  normal  0.304199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  42.59 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.86 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.86 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.86 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1045  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.86 
 
 
110 aa  95.9  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  44.55 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.25 
 
 
124 aa  94.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  39.25 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  36.45 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
107 aa  94  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
111 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2144  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.12 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253252  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  42.06 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  41.12 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  37.38 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  41.12 
 
 
168 aa  92.8  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  45.28 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  42.99 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11154  predicted protein  41.51 
 
 
105 aa  92  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  41.12 
 
 
107 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  42.99 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  42.99 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  42.99 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  42.99 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  42.99 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1694  FeS assembly scaffold SufA  40.19 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.894129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  42.99 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  42.99 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  40.19 
 
 
107 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2179  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
107 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00700081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  43.93 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  39.81 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  38.32 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>