More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0667 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0667  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0115559  normal  0.304199 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0201  HesB/YadR/YfhF  80.51 
 
 
120 aa  193  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2913  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  84.35 
 
 
124 aa  185  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.943212 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  43.75 
 
 
119 aa  105  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  45.61 
 
 
242 aa  104  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.07 
 
 
119 aa  100  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04050  iron ion transport-related protein, putative  43.52 
 
 
215 aa  99.8  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11154  predicted protein  42.86 
 
 
105 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  42.73 
 
 
113 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.96 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  42.06 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0890  HesB/YadR/YfhF family protein  37.6 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.046995  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.79 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  38.98 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  41.67 
 
 
110 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  38.6 
 
 
134 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  40.18 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.84 
 
 
123 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
107 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  42.99 
 
 
107 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  38.46 
 
 
134 aa  92  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  40.91 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  38.39 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.29 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  43.93 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  39.47 
 
 
134 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
109 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  42.06 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0408  HesB/YadR/YfhF  34.78 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_9276  predicted protein  40.18 
 
 
110 aa  90.1  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0369403  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2869  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
107 aa  90.5  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.586009  hitchhiker  0.0000000184682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2147  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.99 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00101616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  40.19 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  40.19 
 
 
168 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1581  HesB/YadR/YfhF  40.91 
 
 
186 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617469  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  40.19 
 
 
107 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0631  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.04 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  37.74 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  37.39 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.61 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  40.19 
 
 
107 aa  84.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.57 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.82 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  36.79 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  36.79 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  37.38 
 
 
107 aa  84.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.79 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.25 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  39.25 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.32 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  40 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  39.25 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  38.1 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.05 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  39.25 
 
 
128 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.79 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.39 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  37.38 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  36.11 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.25 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  40.19 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  37.38 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.68 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  40.19 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  39.25 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>