More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2913 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2913  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.943212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0201  HesB/YadR/YfhF  84.17 
 
 
120 aa  204  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0667  HesB/YadR/YfhF  84.35 
 
 
118 aa  203  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0115559  normal  0.304199 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  47.32 
 
 
242 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  42.86 
 
 
119 aa  108  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  44.55 
 
 
113 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.18 
 
 
119 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11154  predicted protein  42.86 
 
 
105 aa  100  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0890  HesB/YadR/YfhF family protein  37.3 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.046995  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.35 
 
 
123 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.07 
 
 
130 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  41.07 
 
 
134 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  44.86 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  42.99 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  40.18 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  39.29 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  38.39 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  42.99 
 
 
107 aa  95.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04050  iron ion transport-related protein, putative  41.67 
 
 
215 aa  95.1  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  38.39 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
126 aa  94  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  36.61 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2869  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.586009  hitchhiker  0.0000000184682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2147  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00101616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  42.59 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_9276  predicted protein  40.18 
 
 
110 aa  92  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0369403  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  41.12 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0631  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.54 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  90.5  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  39.25 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0408  HesB/YadR/YfhF  33.64 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.82 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  41.51 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  41.12 
 
 
107 aa  88.6  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
108 aa  88.6  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.91 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  42.06 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.19 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.61 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.25 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  38.32 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  87  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  41.12 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.42 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  39.25 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  37.38 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  37.38 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1441  HesB/YadR/YfhF, Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0666522  hitchhiker  0.00534365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.38 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  40.18 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  37.38 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.06 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  37.38 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>