More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44699 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  100 
 
 
119 aa  246  7e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10237  iron-sulfur cluster assembly accessory protein Isa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10690)  71.19 
 
 
242 aa  190  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0808107  hitchhiker  0.00613418 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04050  iron ion transport-related protein, putative  57.63 
 
 
215 aa  148  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_9276  predicted protein  45.87 
 
 
110 aa  116  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0369403  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0201  HesB/YadR/YfhF  42.02 
 
 
120 aa  110  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2266  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.9 
 
 
123 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.061086  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0890  HesB/YadR/YfhF family protein  44.88 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.046995  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.64 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.98 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2568  HesB/YadR/YfhF  46.73 
 
 
113 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.53 
 
 
108 aa  107  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  42.99 
 
 
126 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  42.99 
 
 
126 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  49.09 
 
 
111 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11154  predicted protein  50.48 
 
 
105 aa  105  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0667  HesB/YadR/YfhF  43.75 
 
 
118 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0115559  normal  0.304199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
130 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
126 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  40.17 
 
 
134 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.52 
 
 
107 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.86 
 
 
126 aa  103  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.25 
 
 
118 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.32 
 
 
125 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  39.45 
 
 
134 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.52 
 
 
107 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  41.28 
 
 
134 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.52 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.57 
 
 
107 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.67 
 
 
107 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.71 
 
 
107 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2913  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.07 
 
 
124 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.943212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.67 
 
 
107 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.57 
 
 
107 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  38.89 
 
 
110 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.96 
 
 
119 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.52 
 
 
107 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0103  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.89 
 
 
124 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.62 
 
 
107 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.57 
 
 
115 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.57 
 
 
115 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.71 
 
 
107 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  45.71 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.76 
 
 
107 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  37.38 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  38.18 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  47.62 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  44.76 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.45 
 
 
123 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.71 
 
 
107 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.57 
 
 
107 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.71 
 
 
107 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.62 
 
 
122 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
106 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
106 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  39.09 
 
 
134 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  43.81 
 
 
107 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.71 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.62 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  39.45 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.62 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.67 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  46.67 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  45.28 
 
 
106 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
106 aa  98.2  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  38.32 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  44.76 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.76 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.45 
 
 
110 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.45 
 
 
110 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  42.86 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  42.86 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.82 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  43.81 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  44.76 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.86 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1479  HesB/YadR/YfhF family protein  45.28 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  42.86 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2525  HesB/YadR/YfhF  39.62 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00201416  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.81 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  36.94 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  44.76 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0408  HesB/YadR/YfhF  43.36 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.2 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  42.86 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>