More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3622 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
106 aa  218  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  64.15 
 
 
107 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  66.67 
 
 
106 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.32 
 
 
106 aa  124  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  56.19 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  54.29 
 
 
106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  58.1 
 
 
106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.29 
 
 
106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.21 
 
 
107 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.33 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
106 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  52.83 
 
 
107 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.48 
 
 
106 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  49.52 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  48.11 
 
 
127 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
127 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
127 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
127 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
118 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
116 aa  100  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
119 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  47.17 
 
 
107 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
119 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  42.31 
 
 
130 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  39.42 
 
 
128 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  46.23 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  40.38 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  39.42 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  42.31 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  42.59 
 
 
123 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.69 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
110 aa  90.5  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.85 
 
 
109 aa  90.1  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.69 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.75 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
108 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  40.95 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.91 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
116 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
124 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
119 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  44.44 
 
 
108 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.1 
 
 
133 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.72 
 
 
117 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.68 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2752  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  41.35 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203289  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.9 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  42.86 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.05 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.05 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.9 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.75 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2084  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
116 aa  88.2  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.05 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
206 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.75 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2450  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  40.38 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.121814  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  48.08 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
110 aa  87.4  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  39.05 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0879  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216365  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.86 
 
 
123 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.9 
 
 
108 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.86 
 
 
123 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
115 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
108 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.86 
 
 
123 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
118 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
113 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.86 
 
 
123 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  39.62 
 
 
141 aa  87  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  40.95 
 
 
113 aa  87  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.9 
 
 
116 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.9 
 
 
116 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.9 
 
 
116 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.86 
 
 
123 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.86 
 
 
123 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.96 
 
 
108 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.9 
 
 
116 aa  87  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.78 
 
 
116 aa  86.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  43.14 
 
 
120 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
120 aa  86.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.05 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.9 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440917  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  38.83 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2179  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  41.35 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0547906  hitchhiker  0.000501841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>