More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1561 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
108 aa  219  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  63.89 
 
 
108 aa  143  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.11 
 
 
108 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.26 
 
 
108 aa  139  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.47 
 
 
109 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  59.63 
 
 
125 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.63 
 
 
109 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.47 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
110 aa  110  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.53 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  50 
 
 
107 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 
120 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
116 aa  103  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
110 aa  103  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  48.62 
 
 
106 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
120 aa  102  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50.46 
 
 
113 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  48.6 
 
 
123 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4552  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.87 
 
 
138 aa  102  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.685133  normal  0.324174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  48.62 
 
 
106 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
147 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
116 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  45.79 
 
 
141 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  40.74 
 
 
126 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2452  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
121 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  39.81 
 
 
126 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  40.74 
 
 
126 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.71 
 
 
106 aa  100  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.71 
 
 
106 aa  100  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.74 
 
 
126 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
148 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
127 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.79 
 
 
118 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.79 
 
 
118 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.93 
 
 
123 aa  100  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0047  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
109 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  46.79 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
105 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  47.22 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.89 
 
 
125 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.07 
 
 
107 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0334  HesB/YadR/YfhF  46.49 
 
 
143 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
121 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.79 
 
 
116 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.15 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  47.22 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  42.99 
 
 
113 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3829  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.74 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
116 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  48.15 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  48.15 
 
 
111 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.3 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
120 aa  97.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.3 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  49.07 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.3 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
109 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.15 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.3 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.3 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.74 
 
 
119 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  46.3 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  42.99 
 
 
110 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
141 aa  96.7  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.37 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.86 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.86 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.3 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.86 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  47.22 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.22 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  47.22 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  47.22 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.37 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.86 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.86 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.86 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  46.3 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  45.37 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.37 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.19 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>