More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1342 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
115 aa  241  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.31 
 
 
116 aa  142  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.47 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.15 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.27 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.63 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  48.6 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.66 
 
 
108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.33 
 
 
120 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
109 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
108 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0762  Fe-S cluster formation protein  50.55 
 
 
105 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  47.41 
 
 
125 aa  104  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.14 
 
 
123 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.52 
 
 
127 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.52 
 
 
127 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.01 
 
 
118 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.01 
 
 
118 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  40.94 
 
 
127 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5062  HesB/YadR/YfhF-family protein  46.15 
 
 
99 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589222  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
105 aa  97.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  46.15 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
147 aa  97.1  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  45.79 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.48 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.48 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.48 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.48 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.48 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.48 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.48 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.48 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.48 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.15 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.92 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  42.11 
 
 
116 aa  94.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  44.44 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.44 
 
 
118 aa  94.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.96 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.44 
 
 
109 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.44 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.37 
 
 
109 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.36 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.74 
 
 
110 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.83 
 
 
118 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  40.71 
 
 
117 aa  94  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.07 
 
 
128 aa  94  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.74 
 
 
110 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.18 
 
 
141 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.59 
 
 
117 aa  94  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0047  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.73 
 
 
109 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.52 
 
 
115 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.37 
 
 
116 aa  93.2  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.74 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.74 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  38.74 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.74 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.96 
 
 
130 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  42.59 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
116 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.04 
 
 
108 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.66 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  45.87 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.44 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.44 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  42.06 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  42.06 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.64 
 
 
116 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.95 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.87 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.38 
 
 
114 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.37 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  41.44 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  42.86 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3149  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.025262  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.74 
 
 
116 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1163  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.267725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440917  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.71 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1208  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.371848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
116 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
116 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
116 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.03 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.74 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.74 
 
 
124 aa  90.1  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
123 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.1 
 
 
121 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.1 
 
 
121 aa  90.5  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.74 
 
 
124 aa  90.1  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>