More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3356 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
109 aa  223  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.47 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  58.72 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.55 
 
 
108 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.47 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  58.18 
 
 
125 aa  121  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.45 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
115 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.53 
 
 
120 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.71 
 
 
118 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  50.46 
 
 
107 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.71 
 
 
118 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.47 
 
 
118 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.71 
 
 
116 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.62 
 
 
116 aa  101  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  48.62 
 
 
118 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.54 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4552  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.12 
 
 
138 aa  98.2  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.685133  normal  0.324174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  51.38 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.62 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.28 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.74 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  50.46 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  49.54 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.87 
 
 
118 aa  97.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
127 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.12 
 
 
110 aa  97.1  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
127 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  44.86 
 
 
127 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  47.71 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  48.18 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  50.46 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  47.71 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  46.79 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  47.71 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0951  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.18 
 
 
106 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.031021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.18 
 
 
106 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  43.52 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.66 
 
 
121 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  40.37 
 
 
126 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.87 
 
 
118 aa  94  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.87 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  48.18 
 
 
106 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  46.79 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.71 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2571  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.37 
 
 
113 aa  92  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.37717  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.71 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.71 
 
 
115 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.79 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  48.62 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0156  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  46.36 
 
 
107 aa  92  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.71 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.91 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  46.79 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
120 aa  92  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  46.36 
 
 
107 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  46.36 
 
 
107 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.79 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  37.61 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  37.61 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.79 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.79 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.04 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.04 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.04 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.04 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  42.06 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.61 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.87 
 
 
107 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002592  probable iron binding protein from the HesB_IscA_SufA family  43.52 
 
 
113 aa  90.5  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000217279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.78 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.27 
 
 
113 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.87 
 
 
122 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.37 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03416  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.37 
 
 
116 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.37 
 
 
116 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.37 
 
 
116 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.87 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2902  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.2 
 
 
117 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302151  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.37 
 
 
108 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.87 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  42.59 
 
 
110 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01321  hypothetical protein  51.69 
 
 
130 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00565466  normal  0.345685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.87 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  45.87 
 
 
107 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  46.79 
 
 
107 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.79 
 
 
118 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  46.79 
 
 
107 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.04 
 
 
107 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  44.95 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
113 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2147  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.12 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00101616  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0879  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.2 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1163  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
116 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.267725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  34.86 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>