More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3150 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
108 aa  219  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  75.93 
 
 
108 aa  172  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  66.67 
 
 
108 aa  159  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.11 
 
 
108 aa  142  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  58.18 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.09 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.47 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  50.46 
 
 
118 aa  113  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.46 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.46 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.66 
 
 
115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.15 
 
 
110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2902  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.87 
 
 
117 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302151  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.71 
 
 
118 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.54 
 
 
116 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.62 
 
 
118 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
118 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
123 aa  104  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.66 
 
 
105 aa  103  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  51.85 
 
 
107 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  51.85 
 
 
107 aa  103  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  51.85 
 
 
109 aa  103  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  51.85 
 
 
109 aa  103  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  51.85 
 
 
107 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  51.85 
 
 
109 aa  103  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  51.85 
 
 
109 aa  103  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  51.85 
 
 
107 aa  103  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  51.85 
 
 
107 aa  103  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0047  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
109 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2180  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50 
 
 
107 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000819662  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  50.93 
 
 
107 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2288  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50 
 
 
107 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0828937  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.51 
 
 
127 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
147 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
120 aa  101  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3829  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.02 
 
 
110 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  50 
 
 
107 aa  100  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  50 
 
 
107 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  50 
 
 
107 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  51.85 
 
 
107 aa  100  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
116 aa  100  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  50.93 
 
 
107 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2144  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.07 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  51.85 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.3 
 
 
116 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  46.43 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  50 
 
 
107 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  46.23 
 
 
141 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  52.78 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  50.93 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  50.93 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  50.93 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  56.63 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  50.93 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  51.85 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  51.85 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  51.85 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  63.86 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2740  iron-sulfur cluster assembly protein  50.93 
 
 
107 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.93 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
116 aa  97.4  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.36 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.6 
 
 
127 aa  97.1  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.36 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0879  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.79 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216365  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.6 
 
 
127 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  50 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  40.19 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2452  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50.93 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  59.04 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0036  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  46.79 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  50.6 
 
 
127 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.29 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0044  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.709192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1027  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.71 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00699408  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  49.07 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  49.07 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.07 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.3 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  49.07 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  59.04 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  41.12 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01321  hypothetical protein  44.74 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00565466  normal  0.345685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  50.93 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.27 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  59.04 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  49.07 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.3 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  49.07 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  61.45 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  42.99 
 
 
113 aa  94.7  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01341  hypothetical protein  43.86 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>