More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2021 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
110 aa  225  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  49.07 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  45.37 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.15 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
120 aa  108  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
109 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
108 aa  103  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2084  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
116 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
119 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
133 aa  100  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
115 aa  98.6  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  42.45 
 
 
123 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1664  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.12 
 
 
121 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.12 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.12 
 
 
109 aa  97.1  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
120 aa  96.7  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2218  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.44 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0238312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1955  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000220764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1456  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0753774  normal  0.435352 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12230  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
130 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.40084  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  decreased coverage  0.00532589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  40.74 
 
 
118 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
116 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15600  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
116 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722466  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
120 aa  93.6  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  41.51 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.34 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.12 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3349  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16270  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.591813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  43.12 
 
 
117 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.37 
 
 
110 aa  92  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  44.23 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3082  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.75 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0030958  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.67 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3302  HesB/YadR/YfhF  52.5 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3313  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.5 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3364  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.5 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0837233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
106 aa  90.5  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.2 
 
 
110 aa  90.1  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0036  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.74 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0044  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.74 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.709192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.32 
 
 
124 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  40 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12232  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000227512  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10610  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.25 
 
 
125 aa  88.2  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.213974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2945  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.25 
 
 
125 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648608  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
105 aa  87.4  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.79 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.79 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3568  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.25 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0534346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  40 
 
 
107 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.09 
 
 
114 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.09 
 
 
114 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.09 
 
 
114 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.09 
 
 
114 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.09 
 
 
114 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3258  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.19 
 
 
122 aa  87  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0083346  hitchhiker  0.0000911572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1044  HesB/YadR/YfhF  42.45 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0515022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  35.85 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  38.18 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3446  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.18 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3064  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.75 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.79 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2902  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.89 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302151  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  39.81 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.27 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.18 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.18 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  38.18 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.18 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.19 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.38 
 
 
124 aa  86.3  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.18 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  40 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.81 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.81 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.81 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.81 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.18 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.18 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.54 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0658  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.19 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.27 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  84.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  40.37 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1291  HesB/YadR/YfhF  36.45 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0112575  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2452  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
121 aa  85.5  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0066  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.18 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.91 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>