More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04435 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  100 
 
 
125 aa  254  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  73.39 
 
 
109 aa  166  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  62.73 
 
 
108 aa  143  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.63 
 
 
108 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.18 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.88 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.18 
 
 
109 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.41 
 
 
115 aa  104  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.18 
 
 
116 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
120 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  47.27 
 
 
118 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  50.46 
 
 
107 aa  102  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.45 
 
 
128 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.27 
 
 
118 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  42.06 
 
 
123 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
116 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  40.91 
 
 
141 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
116 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.62 
 
 
118 aa  100  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  44.44 
 
 
113 aa  100  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.71 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
116 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.45 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
116 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  43.52 
 
 
110 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  40.37 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.76 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
116 aa  96.7  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.87 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01321  hypothetical protein  42.61 
 
 
130 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00565466  normal  0.345685 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.45 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  45.37 
 
 
130 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
127 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.57 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.57 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  42.34 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0036  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  39.45 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
105 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0044  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.709192 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.64 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.55 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  44.55 
 
 
106 aa  94.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3067  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.34 
 
 
124 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  45.87 
 
 
107 aa  94.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  45.87 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03416  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.17 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
116 aa  94.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  38.53 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.66 
 
 
123 aa  94.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2673  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.34 
 
 
124 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.407171  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  38.68 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  44.44 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.39 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2452  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.84 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
114 aa  94  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
114 aa  94  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
114 aa  94  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  37.61 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
123 aa  94  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
123 aa  94  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
114 aa  94  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
114 aa  94  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
123 aa  94  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.79 
 
 
119 aa  94  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0909  HesB/YadR/YfhF  46.79 
 
 
118 aa  94  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0796316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.85 
 
 
127 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0047  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.64 
 
 
109 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.96 
 
 
122 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.85 
 
 
127 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.81 
 
 
122 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
114 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  42.2 
 
 
107 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.81 
 
 
122 aa  93.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  41.67 
 
 
114 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
114 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
114 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01901  hypothetical protein  42.98 
 
 
129 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
114 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.81 
 
 
122 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>