More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0909 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0909  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
118 aa  244  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0796316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  70.34 
 
 
118 aa  181  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  70.69 
 
 
116 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  67.24 
 
 
118 aa  171  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  67.24 
 
 
118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2902  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  68.64 
 
 
117 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302151  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.41 
 
 
118 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.41 
 
 
118 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01321  hypothetical protein  65.55 
 
 
130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00565466  normal  0.345685 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0334  HesB/YadR/YfhF  66.1 
 
 
143 aa  160  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26221  hypothetical protein  65.29 
 
 
130 aa  159  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.49947 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01901  hypothetical protein  59.69 
 
 
129 aa  157  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2357  HesB/YadR/YfhF  66.1 
 
 
130 aa  157  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1485  hypothetical protein  59.69 
 
 
129 aa  157  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.885588  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01331  hypothetical protein  62.28 
 
 
130 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01301  hypothetical protein  60.5 
 
 
130 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01341  hypothetical protein  62.28 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0119  hypothetical protein  62.28 
 
 
130 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14867  predicted protein  61.63 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.47906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  45.76 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  46.79 
 
 
125 aa  103  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.93 
 
 
107 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  41.12 
 
 
107 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  40.19 
 
 
107 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  44.04 
 
 
108 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  42.45 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.79 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0658  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
110 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0472  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  39.25 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  38.32 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.04 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
110 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  45.37 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1948  hypothetical protein  39.45 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04050  iron ion transport-related protein, putative  39.45 
 
 
215 aa  95.1  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  39.25 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  38.32 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1146  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.12 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140642  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  41.12 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  42.06 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1291  HesB/YadR/YfhF  43.4 
 
 
112 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0112575  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3829  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.28 
 
 
110 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
118 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  37.38 
 
 
107 aa  94  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.28 
 
 
108 aa  93.6  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.38 
 
 
107 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
109 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.19 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2147  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.38 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00101616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0599  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.43 
 
 
118 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  40.19 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3257  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.45 
 
 
119 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319112  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15600  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.68 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722466  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.53 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.91 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  40.37 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.91 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.25 
 
 
107 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.91 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.91 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.91 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.91 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.91 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  38.53 
 
 
117 aa  92  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.91 
 
 
107 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.25 
 
 
122 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  43.52 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.52 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  43.52 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  40.95 
 
 
106 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.45 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.45 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.45 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.45 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  43.52 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  43.52 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1060  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  38.32 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>