More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3609 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
116 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.31 
 
 
115 aa  142  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  46.73 
 
 
108 aa  105  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.93 
 
 
108 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.74 
 
 
147 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
108 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
127 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
108 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0762  Fe-S cluster formation protein  40 
 
 
105 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
123 aa  99.4  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.04 
 
 
118 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.95 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.95 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
110 aa  93.2  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.12 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5062  HesB/YadR/YfhF-family protein  46.15 
 
 
99 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589222  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  43.4 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2902  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.66 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302151  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  39.45 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.2 
 
 
109 aa  89.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
105 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.12 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  41.82 
 
 
113 aa  88.6  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1793  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.82 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.872961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.28 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.45 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.28 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  42.59 
 
 
117 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.28 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.37 
 
 
116 aa  87.8  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0414  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.45 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.45 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.72 
 
 
124 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.72 
 
 
124 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.74 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.72 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.28 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.74 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.28 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.28 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.28 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  50 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3067  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.79 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.28 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.37 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.28 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.28 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.28 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.37 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  39.82 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2673  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.79 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.407171  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.74 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
206 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  44.04 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.59 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  43.12 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0992  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3457  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.549303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  41.74 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  38.21 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.74 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3328  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.74 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.74 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.18 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.74 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16270  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.591813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.59 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.07 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  38.89 
 
 
117 aa  84.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.74 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.37 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.45 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  37.96 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2571  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.45 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.37717  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  41.9 
 
 
206 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.09 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.71 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.71 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.17 
 
 
115 aa  84  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1567  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
125 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.679568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3349  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.93 
 
 
115 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.94 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.64 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.71 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  40 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.64 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1442  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.37 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402332  hitchhiker  0.0055287 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.61 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.25 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.85 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>