More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0532 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
106 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  89.62 
 
 
106 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  58.1 
 
 
107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  58.1 
 
 
106 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  57.14 
 
 
106 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  52.38 
 
 
107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.1 
 
 
106 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.29 
 
 
106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  49.52 
 
 
107 aa  114  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.38 
 
 
106 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.57 
 
 
106 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  51.43 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.43 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
105 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
118 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  43.27 
 
 
113 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
127 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
107 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  46.67 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2452  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2494  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.81 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.176727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
127 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  42.86 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  46.15 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  44.23 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.27 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  41.35 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.31 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.14 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
116 aa  94  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.31 
 
 
128 aa  93.6  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
102 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  45.1 
 
 
117 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1581  HesB/YadR/YfhF  46.15 
 
 
186 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617469  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.14 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  42.31 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.31 
 
 
116 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.12 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  41.35 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
125 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
124 aa  91.7  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.14 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  40.38 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  45.63 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
130 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
108 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
124 aa  90.5  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1208  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.371848  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.12 
 
 
116 aa  90.1  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.16 
 
 
117 aa  90.1  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  41.35 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1163  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.267725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440917  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3149  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.025262  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.08 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
116 aa  90.1  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  42.31 
 
 
117 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.18 
 
 
120 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
115 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1442  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
124 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402332  hitchhiker  0.0055287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  43.27 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.27 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  42.86 
 
 
130 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>