45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2363 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2363  sarcosine oxidase gamma subunit  100 
 
 		 153 aa  296  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  39.47 
 
 		 201 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1946  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.13 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  36.18 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.87 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  41.82 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5632  Sarcosine oxidase gamma subunit  39.8 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1144  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.01 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7230  Sarcosine oxidase gamma subunit  46.58 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0171161  normal  0.102806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  36.55 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3286  sarcosine oxidase gamma subunit  36.52 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  28.67 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  28.67 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3448  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.26 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  35.56 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  27.97 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  27.97 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  29.37 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2639  Sarcosine oxidase gamma subunit  32.67 
 
 		 209 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5743  hypothetical protein  32.69 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.86 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.86 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  34.62 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.29 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  33.04 
 
 		 210 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.9 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2263  putative sarcosine oxidase  40.62 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  28.68 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  29.2 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  27.34 
 
 		 211 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  27.34 
 
 		 211 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  26.85 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  25.5 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  30.23 
 
 		 210 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  26.8 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2484  sarcosine oxidase gamma subunit  33.9 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  30.72 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.46 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3994  Sarcosine oxidase gamma subunit  28.44 
 
 		 196 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4034  Sarcosine oxidase gamma subunit  30.3 
 
 		 196 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.484424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3739  sarcosine oxidase gamma subunit  30.3 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319491  normal  0.115073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  27.48 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4906  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.99 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.167294 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8587  Sarcosine oxidase gamma subunit  31.58 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2144  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.04 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>