52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3383 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3383  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  47.09 
 
 
218 aa  181  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  40.38 
 
 
213 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  45.51 
 
 
201 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  41.49 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  42.13 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  40.91 
 
 
173 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  38.6 
 
 
172 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  38.74 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  37.1 
 
 
499 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  39.34 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  41.48 
 
 
190 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  40.91 
 
 
190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  38.6 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  40.91 
 
 
190 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  38.22 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  38.15 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  35.64 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  36.99 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  35.03 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  35.43 
 
 
190 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  37.87 
 
 
175 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  32 
 
 
477 aa  99  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  33.73 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  30.86 
 
 
176 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  31.72 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  31.51 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  28.57 
 
 
214 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  28.97 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  25.63 
 
 
231 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  25 
 
 
177 aa  52.8  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  27.19 
 
 
393 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  26.55 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  23.47 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  27.35 
 
 
394 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  27.35 
 
 
394 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  26.32 
 
 
393 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  27.35 
 
 
394 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  28 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  35.63 
 
 
653 aa  48.5  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  36 
 
 
645 aa  48.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  26.5 
 
 
394 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  27.78 
 
 
395 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3661  hypothetical protein  28.03 
 
 
132 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
657 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  33.64 
 
 
640 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  29.36 
 
 
644 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  31.53 
 
 
664 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  29.36 
 
 
649 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 
738 aa  41.6  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>