179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0635 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0635  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 291 aa  569  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.996805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0169  phosphoribulokinase  34.5 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0629486  normal  0.335494 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0113  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.55 
 
 		 312 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  42.55 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1845  phosphoribulokinase  39.3 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0997041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1650  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.2 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00630764  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.34 
 
 		 343 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3252  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.93 
 
 		 322 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.570797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0781  phosphoribulokinase  38.55 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000028784  unclonable  0.0000000817454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.91 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  36.96 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3980  phosphoribulokinase  34.67 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000234967  decreased coverage  0.00010781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3931  phosphoribulokinase  34.67 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  37.91 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.43 
 
 		 340 aa  125  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3654  phosphoribulokinase  35.16 
 
 		 336 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4839  Phosphoribulokinase  35.2 
 
 		 333 aa  123  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.36 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5200  phosphoribulokinase  36.26 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  1.4377100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.07 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  35.16 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0794  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.62 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0142464  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.24 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_50773  phosphoribulokinase  27.87 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45513  predicted protein  27.14 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1993  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.04 
 
 		 695 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0026662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2748  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.03 
 
 		 716 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  31.52 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1606  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.12 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.397459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  30.16 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  29.47 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.18 
 
 		 217 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  29.69 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  25.62 
 
 		 213 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  26.11 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  30.57 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  29.84 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  31.15 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  28.04 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  28.02 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  29.79 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  30.24 
 
 		 207 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  26.6 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  29 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  29 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  29 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  29 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  27.32 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  29.17 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  29 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  29.1 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  29.1 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  29.1 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  29.1 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0115  uridine kinase  27.47 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.54495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  30.43 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  29.21 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  29.41 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  28 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  29.1 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  28.42 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  28 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  27.03 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  26.83 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  27.03 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  25.97 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  26.84 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  26.53 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.19 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  28.57 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2005  uridine kinase  29.7 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  28.57 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0736  uridine kinase  28.88 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  28.57 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4500  uridine kinase  28.88 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  28.57 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3093  uridine kinase  28.88 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  28.57 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4276  uridine kinase  28.34 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4113  uridine kinase  28.34 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4124  uridine kinase  28.34 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4608  uridine kinase  28.34 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4460  uridine kinase  28.34 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0770159 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  25.14 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  27.23 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14051  hypothetical protein  17.74 
 
 		 682 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.213497  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  27.23 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4462  uridine kinase  28.34 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  23.78 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  26.67 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  26.24 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4513  uridine kinase  28.34 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  27.23 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>