23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14051 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_14051  hypothetical protein  100 
 
 
682 aa  1321    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.213497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1993  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.7 
 
 
695 aa  325  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0026662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2748  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.22 
 
 
716 aa  181  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0635  phosphoribulokinase/uridine kinase  17.74 
 
 
291 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.996805  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.14 
 
 
321 aa  59.3  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  20.36 
 
 
343 aa  58.9  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  22.28 
 
 
321 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  25.18 
 
 
211 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1845  phosphoribulokinase  19.78 
 
 
311 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0997041  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3252  ribulose-phosphate 3-epimerase  20.21 
 
 
322 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.570797  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  21.98 
 
 
322 aa  52.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.02 
 
 
325 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  19.05 
 
 
340 aa  52.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0113  phosphoribulokinase/uridine kinase  21.11 
 
 
312 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  19.15 
 
 
313 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1606  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.14 
 
 
433 aa  49.3  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.397459  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0794  phosphoribulokinase/uridine kinase  21.67 
 
 
323 aa  48.5  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0142464  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0169  phosphoribulokinase  20.33 
 
 
313 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0629486  normal  0.335494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  22.86 
 
 
211 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1650  phosphoribulokinase/uridine kinase  19.25 
 
 
315 aa  47.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00630764  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  42.59 
 
 
232 aa  47.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  29.01 
 
 
232 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  26.09 
 
 
219 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>