More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0974 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  457  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  75.8 
 
 
219 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  70.18 
 
 
228 aa  319  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  69.74 
 
 
228 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  67.54 
 
 
228 aa  308  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  57.46 
 
 
232 aa  270  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  57.33 
 
 
228 aa  263  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  55.26 
 
 
228 aa  255  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0432  hypothetical protein  52.63 
 
 
223 aa  226  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 
228 aa  216  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  40.85 
 
 
215 aa  141  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  43.16 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 
229 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.19 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 
223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  36.49 
 
 
215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 
223 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  36.23 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 
223 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.32 
 
 
224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  31.92 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  36.07 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 
234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 
232 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  36.5 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 
219 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 
219 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 
218 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  32.37 
 
 
236 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 
226 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 
221 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  34.87 
 
 
221 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  35.2 
 
 
217 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 
226 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 
222 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 
217 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  29.76 
 
 
216 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 
219 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  34.52 
 
 
237 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  34.52 
 
 
237 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  36.98 
 
 
222 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 
214 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 
217 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 
219 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 
219 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  29.27 
 
 
220 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  28.28 
 
 
237 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  32.34 
 
 
236 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  32.82 
 
 
233 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 
217 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  30.3 
 
 
241 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  30.3 
 
 
242 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
222 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 
231 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  30.3 
 
 
241 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  34.85 
 
 
253 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  30.5 
 
 
220 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 
219 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  31.71 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  30.66 
 
 
218 aa  99.8  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  31.71 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 
219 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  28.24 
 
 
234 aa  99.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  33.71 
 
 
256 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  33.71 
 
 
256 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  33.71 
 
 
256 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0585  phosphate uptake regulator, PhoU  35.78 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.504755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  29.44 
 
 
243 aa  98.2  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 
222 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  34.76 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  27.7 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  32.73 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  28.18 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.17 
 
 
247 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  30.16 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  32.5 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  32.5 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  29.17 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.16 
 
 
236 aa  95.9  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.33 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  34.29 
 
 
253 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  32.83 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  34.15 
 
 
219 aa  95.1  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0265  phosphate uptake regulator, PhoU  30.49 
 
 
237 aa  94.7  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  30.56 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>