More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6075 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
390 aa  784    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  56.42 
 
 
376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  57.07 
 
 
399 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  55.15 
 
 
373 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  54.91 
 
 
374 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  54.23 
 
 
376 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  60.43 
 
 
374 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  53.19 
 
 
388 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  54.38 
 
 
374 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  57.94 
 
 
376 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  57.03 
 
 
377 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  55.44 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  52.12 
 
 
375 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  51.2 
 
 
374 aa  354  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  51.85 
 
 
375 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  51.85 
 
 
375 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  53.58 
 
 
376 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  52.5 
 
 
379 aa  348  9e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  52.73 
 
 
385 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  53.35 
 
 
382 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
374 aa  338  9e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  52.43 
 
 
396 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  54.11 
 
 
384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  53.02 
 
 
378 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  45.43 
 
 
423 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  51.56 
 
 
398 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  42.4 
 
 
422 aa  249  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  37.76 
 
 
377 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
770 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
409 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
384 aa  139  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.39 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  28.14 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  30.71 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
386 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
392 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
359 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  32.56 
 
 
402 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
378 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  30.53 
 
 
383 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 
380 aa  109  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
377 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 
370 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
378 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
414 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
405 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
360 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
419 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
408 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 
389 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
378 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
378 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
414 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  37.38 
 
 
399 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
408 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
414 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  31.43 
 
 
414 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  39.66 
 
 
376 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.38 
 
 
365 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
399 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
415 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
364 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
378 aa  100  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
392 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
399 aa  99.8  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.14 
 
 
770 aa  99.8  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 
385 aa  99.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
371 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
378 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
406 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
409 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
384 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
404 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
423 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
360 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  27.35 
 
 
378 aa  97.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  39.66 
 
 
388 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
413 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
377 aa  96.3  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
381 aa  96.3  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
404 aa  95.9  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  34.63 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
392 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.57 
 
 
935 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
410 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
403 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
378 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
430 aa  92.8  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0937  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
369 aa  92.8  9e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>