45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5890 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  100 
 
 		 255 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  51.82 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  48.22 
 
 		 246 aa  208  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  47.43 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  47.24 
 
 		 245 aa  195  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  46.15 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  44.67 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  45.24 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  43.65 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  41.7 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  50.21 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  48.35 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  42.86 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  39.68 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  45.67 
 
 		 246 aa  164  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  45.71 
 
 		 242 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  45 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  42.86 
 
 		 242 aa  159  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  41.3 
 
 		 247 aa  158  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  43.03 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  40.74 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  45.23 
 
 		 249 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  39.68 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  44.02 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  36.73 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  37.04 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  38.31 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  36.8 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  39.2 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  37.5 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  37.5 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  37.5 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  36.51 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  20.45 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  31.28 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  26.9 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  28.63 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  26.89 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  24.06 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  23.73 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  25.41 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  25.11 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  24.31 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  20.37 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  26.51 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>