More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5790 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  56.73 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  55.66 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  52.43 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  42.42 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  42.42 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  38.68 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  41.41 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  41.07 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  43.43 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  39.84 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  38.38 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  42 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  41.41 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  38.38 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  40.59 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  44.34 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  42.42 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 111 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  46.59 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  40.4 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  40.4 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  39.6 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  42.05 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  41.75 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  41.84 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  40.82 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  41 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  43 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4507  PadR-like family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2356  PadR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  43 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  43 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  43 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  43 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  43 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  42.27 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  42.7 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  43 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  43 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  36.27 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  36.73 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  36.73 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  35.64 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  41.57 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  39.42 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  35.64 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  36.73 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  36.73 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  36.73 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  38.61 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  38.71 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  38.61 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  38.61 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  38.61 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
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NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  39.58 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
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NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  37.14 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  37.62 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  37.86 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  40.91 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  37.86 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_2172  transcriptional regulator, PadR-like family  43.18 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  37.62 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  41.94 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  37.62 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
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NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  38.1 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
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NC_007954  Sden_0473  transcriptional regulator PadR-like protein  37.62 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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