43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5212 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5212  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0791068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0460  hypothetical protein  45.39 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0570111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2334  hypothetical protein  47.14 
 
 		 303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0829  hypothetical protein  46.6 
 
 		 299 aa  251  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9267  hypothetical protein  45.89 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1899  hypothetical protein  45.45 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00890991  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1491  hypothetical protein  40.75 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1513  hypothetical protein  40.75 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06700  hypothetical protein  43.49 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1489  hypothetical protein  40.75 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2088  hypothetical protein  41.64 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0357677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0937  hypothetical protein  40.47 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1389  hypothetical protein  32.88 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1552  hypothetical protein  34.92 
 
 		 308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5032  hypothetical protein  32.17 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124208  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10902  hypothetical protein  31.65 
 
 		 340 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1719  hypothetical protein  33.02 
 
 		 342 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116958  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6829  hypothetical protein  28.19 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1477  hypothetical protein  28.06 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4846  hypothetical protein  32.24 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0398901 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4550  hypothetical protein  32.24 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233569  normal  0.516258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4463  hypothetical protein  32.24 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160835  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2944  hypothetical protein  30.36 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1071  hypothetical protein  28.07 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2861  hypothetical protein  26.38 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1563  hypothetical protein  28.04 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.128095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1962  hypothetical protein  26.26 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2323  hypothetical protein  26.26 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2316  hypothetical protein  28.28 
 
 		 327 aa  99.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442681  normal  0.270132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1197  hypothetical protein  28.81 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735296  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0696  hypothetical protein  26.07 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0534  hypothetical protein  24.55 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  21.43 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  23.1 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  23.67 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1069  hypothetical protein  23.87 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  23.4 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  21.11 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  22.78 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  23.16 
 
 		 366 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  20.37 
 
 		 371 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  21.71 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  20.54 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>