More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2701 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2701  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 67 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4566  putative cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0641574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7468  cold-shock DNA-binding domain protein  75.76 
 
 		 68 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  67.16 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 67 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4477  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  98.6  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  67.16 
 
 		 67 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1263  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1900  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  94  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.7 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1465  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.359616  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10670  cold-shock DNA-binding protein family  62.69 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00582905  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  66.67 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  decreased coverage  0.000196654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2869  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.08 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0181409  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.64 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 68 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 94 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265568  normal  0.248856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02500  cold-shock DNA-binding protein family  62.9 
 
 		 62 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  59.09 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0279  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  62.12 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.7 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  62.12 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0614  cold shock-like protein  66.13 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.099487  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 68 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.21 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  59.7 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2202  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3760  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.15 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.780435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2061  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.131927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.21 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.21 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 68 aa  87.8  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0777  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.61 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0892  cold-shock DNA-binding domain protein  59.09 
 
 		 68 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  63.08 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0384  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.21 
 
 		 68 aa  87.8  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  59.38 
 
 		 68 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3652  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 67 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2279  cold-shock DNA-binding domain protein  64.71 
 
 		 310 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.703886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  61.19 
 
 		 67 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.21 
 
 		 67 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  64.62 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0492  putative cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 65 aa  87  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  63.08 
 
 		 69 aa  87  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>