More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0538 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0538  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 578 aa  1136    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3010  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0536137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4144  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 		 561 aa  323  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3724  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 		 549 aa  320  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 		 536 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  35.34 
 
 		 4342 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1828  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 		 576 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.397575  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  31.64 
 
 		 1801 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  34.8 
 
 		 4342 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  34.17 
 
 		 4317 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 		 1272 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  32.8 
 
 		 1276 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  32.8 
 
 		 1291 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  32.8 
 
 		 1283 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 947 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 586 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.51 
 
 		 4336 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 962 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 595 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  32.07 
 
 		 559 aa  210  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.39 
 
 		 4318 aa  210  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.46 
 
 		 4317 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  29.9 
 
 		 852 aa  210  7e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  32.83 
 
 		 4332 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  32.98 
 
 		 4336 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.57 
 
 		 3235 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 1292 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  29.9 
 
 		 936 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  35.06 
 
 		 3208 aa  207  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  32.28 
 
 		 1323 aa  207  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.33 
 
 		 4317 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 706 aa  206  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  34.57 
 
 		 1779 aa  206  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  33.14 
 
 		 4317 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 958 aa  206  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  27.9 
 
 		 581 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  28.28 
 
 		 581 aa  204  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 839 aa  204  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.92 
 
 		 2762 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.86 
 
 		 6889 aa  203  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  34.39 
 
 		 599 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  30.39 
 
 		 1067 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  32.9 
 
 		 1789 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  33.7 
 
 		 1981 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 610 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.77 
 
 		 546 aa  201  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 599 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.33 
 
 		 2791 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 599 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 610 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 610 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 1776 aa  199  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  30.98 
 
 		 574 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 942 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 603 aa  196  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 586 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 		 597 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  28.43 
 
 		 2997 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  26.82 
 
 		 3099 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 577 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 580 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0198968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 597 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 599 aa  193  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  31.43 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  31.84 
 
 		 576 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  29.37 
 
 		 2820 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  31.84 
 
 		 573 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 958 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  31.08 
 
 		 573 aa  191  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  32.35 
 
 		 1474 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  33.46 
 
 		 1035 aa  190  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  31.6 
 
 		 608 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 586 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  33.52 
 
 		 2250 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  30.89 
 
 		 576 aa  189  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 555 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  30.69 
 
 		 576 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 586 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2049  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 547 aa  187  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.998714  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  33.16 
 
 		 609 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  31.38 
 
 		 585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4912  amino acid adenylation domain protein  32.17 
 
 		 1715 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.650159  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  28.1 
 
 		 1656 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 653 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  31.97 
 
 		 755 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 		 614 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  30.84 
 
 		 619 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 		 611 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  32.48 
 
 		 6403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 949 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  32.97 
 
 		 607 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 622 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  30.65 
 
 		 2721 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  31.71 
 
 		 626 aa  180  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  33.02 
 
 		 593 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>