192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3603 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3603  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1165    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.610443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3711  hypothetical protein  70.14 
 
 		 493 aa  748    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1721  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 		 455 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00272904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1185  L-lysine 2,3-aminomutase  34.87 
 
 		 456 aa  264  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  0.0471893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0373  radical SAM domain-containing protein  34.05 
 
 		 468 aa  244  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1772  lysine 2,3-aminomutase related protein  34.16 
 
 		 448 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3480  hypothetical protein  33.58 
 
 		 484 aa  230  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0272  L-lysine 2,3-aminomutase  34.17 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3329  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0522321  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1404  radical SAM domain protein  34.38 
 
 		 434 aa  226  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0744  hypothetical protein  33.5 
 
 		 442 aa  225  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.161116  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1163  radical SAM domain protein  33.9 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.587423 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0186  L-lysine 2,3-aminomutase  34.09 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.298559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4391  L-lysine 2,3-aminomutase  32.61 
 
 		 445 aa  220  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4154  hypothetical protein  34.37 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0857  hypothetical protein  33.59 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4495  hypothetical protein  33.67 
 
 		 432 aa  213  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.0100424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41820  Lysine 2,3-aminomutase  31.73 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8940  L-lysine 2,3-aminomutase  32.23 
 
 		 461 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34965  predicted protein  32.48 
 
 		 470 aa  200  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0616  L-lysine 2,3-aminomutase  30.92 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_6159  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 		 458 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2692  L-lysine 2,3-aminomutase  31.59 
 
 		 450 aa  191  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.712354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3707  L-lysine 2,3-aminomutase  28.33 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_2771  hypothetical protein  30.62 
 
 		 448 aa  183  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250775 
 
 
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NC_013131  Caci_5255  L-lysine 2,3-aminomutase  29.81 
 
 		 441 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_2058  radical SAM family protein  28.22 
 
 		 480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
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NC_010003  Pmob_0169  lysine 2,3-aminomutase  24.57 
 
 		 370 aa  103  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  25.73 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  21.49 
 
 		 370 aa  95.5  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2387  hypothetical protein  24.73 
 
 		 376 aa  94.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000550657  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0343  L-lysine 2,3-aminomutase  22.5 
 
 		 368 aa  93.2  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0150832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0826  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.59 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.95 
 
 		 365 aa  91.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2747  L-lysine 2,3-aminomutase  21.41 
 
 		 384 aa  87  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0135  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.81 
 
 		 392 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.423107  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1790  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.34 
 
 		 386 aa  83.2  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1455  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.51 
 
 		 323 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1757  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.16 
 
 		 379 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.22 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.28 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.98 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002967  TDE0069  hypothetical protein  24.6 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  24.03 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
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NC_013173  Dbac_0035  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.53 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.03 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  21.99 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.88 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  24.72 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.41 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.99 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  21.93 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.22 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  28.12 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.01 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  22.69 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.86 
 
 		 413 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.05 
 
 		 408 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  25.73 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  24.65 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.84 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.43 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  20.17 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.84 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  29.38 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.4 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3953  Lysine 2,3-aminomutase  28.65 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  25.6 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.85 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.12 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.74 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.78 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.73 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  23.74 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  23.74 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  23.74 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  23.74 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  23.74 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  23.74 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  22.96 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.96 
 
 		 402 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  22.96 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  20.27 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  22.46 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  23.74 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  23.74 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  23.74 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.12 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.1 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.25 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  21.96 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  24.73 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  22.14 
 
 		 730 aa  61.2  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  26.55 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  19.54 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  22.14 
 
 		 708 aa  60.8  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  20.79 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  22.96 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  21.89 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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