More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2522 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  100 
 
 
449 aa  862    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  61.98 
 
 
438 aa  534  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  63.45 
 
 
445 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  48.73 
 
 
451 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  42.92 
 
 
452 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  42.7 
 
 
452 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  40.77 
 
 
452 aa  316  5e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  38.53 
 
 
458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  39.52 
 
 
468 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  39.91 
 
 
461 aa  297  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  39.6 
 
 
500 aa  296  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  41.15 
 
 
455 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  41.15 
 
 
455 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  40.18 
 
 
482 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  41.1 
 
 
466 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  38.6 
 
 
458 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  37.97 
 
 
468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  41.49 
 
 
451 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  36.51 
 
 
450 aa  286  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  39.25 
 
 
452 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  41.73 
 
 
451 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  41.73 
 
 
451 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  41.73 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  38.36 
 
 
460 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  40.6 
 
 
469 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  42.04 
 
 
468 aa  280  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  40.37 
 
 
469 aa  279  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  37.91 
 
 
462 aa  279  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  38.35 
 
 
431 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  37.47 
 
 
503 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  37.77 
 
 
505 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  36.58 
 
 
488 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  38.04 
 
 
462 aa  276  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  37.83 
 
 
489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  37.06 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  38.9 
 
 
459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  36.24 
 
 
470 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  35.37 
 
 
465 aa  272  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  36.23 
 
 
466 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  37.56 
 
 
474 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  37.5 
 
 
461 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  38.7 
 
 
493 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  37.5 
 
 
472 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  38.72 
 
 
462 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  37.95 
 
 
468 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  36.78 
 
 
479 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  38.72 
 
 
462 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  38.26 
 
 
509 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  38.86 
 
 
485 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  37.56 
 
 
462 aa  269  8e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  36.47 
 
 
446 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  39.29 
 
 
440 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  37.5 
 
 
461 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  39.23 
 
 
501 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  38.26 
 
 
506 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  38.54 
 
 
494 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  40.71 
 
 
457 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  36.7 
 
 
497 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  38.35 
 
 
440 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  37.27 
 
 
462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  39.05 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  36.47 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  39.05 
 
 
440 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  36.9 
 
 
462 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  39.05 
 
 
440 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  36.9 
 
 
462 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  36.9 
 
 
462 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  36.9 
 
 
462 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  37.11 
 
 
490 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  37.5 
 
 
487 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  38.66 
 
 
438 aa  266  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  36.9 
 
 
462 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  36.62 
 
 
465 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  38.43 
 
 
440 aa  266  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  38.43 
 
 
440 aa  266  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  38.43 
 
 
440 aa  266  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  38.43 
 
 
440 aa  266  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  36.73 
 
 
509 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  36.9 
 
 
462 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  38.43 
 
 
440 aa  266  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  39.05 
 
 
440 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  37.08 
 
 
505 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  35.8 
 
 
446 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  38.04 
 
 
462 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  36.73 
 
 
466 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  37.08 
 
 
505 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  37.33 
 
 
462 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  37.81 
 
 
462 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  36.84 
 
 
501 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  37.81 
 
 
462 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  37.81 
 
 
462 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  36.55 
 
 
466 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  38.28 
 
 
500 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  37.13 
 
 
464 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  40.14 
 
 
457 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  40.14 
 
 
457 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  40.18 
 
 
475 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  40.18 
 
 
475 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  36.96 
 
 
486 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  37.08 
 
 
505 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>