More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1592 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  100 
 
 
438 aa  839    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  80.92 
 
 
445 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  61.98 
 
 
449 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  46.61 
 
 
451 aa  410  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  43.65 
 
 
452 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  43.42 
 
 
452 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  39.95 
 
 
452 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  39.23 
 
 
465 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  39.41 
 
 
466 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  39.18 
 
 
466 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  39.02 
 
 
500 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  38.99 
 
 
468 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  40.56 
 
 
458 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  40.27 
 
 
466 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  38.07 
 
 
482 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  39.44 
 
 
455 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  39.44 
 
 
455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  37.58 
 
 
468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  36.5 
 
 
462 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  38.73 
 
 
431 aa  272  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  40.27 
 
 
466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  39.78 
 
 
452 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  39.86 
 
 
451 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  39.86 
 
 
451 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  37.21 
 
 
470 aa  267  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  39.35 
 
 
451 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  38.39 
 
 
497 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  39.81 
 
 
468 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  38.76 
 
 
461 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  38.44 
 
 
505 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  37.2 
 
 
449 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  39.62 
 
 
451 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  38.75 
 
 
469 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  39.95 
 
 
458 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  39.4 
 
 
445 aa  263  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  38.52 
 
 
469 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  38.11 
 
 
488 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  36.32 
 
 
466 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  38.08 
 
 
489 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  36.47 
 
 
525 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  36.9 
 
 
525 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  36.69 
 
 
482 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  36.69 
 
 
482 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  36.69 
 
 
482 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  36.69 
 
 
482 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  34.84 
 
 
465 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  36.69 
 
 
482 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  36.69 
 
 
482 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  39.46 
 
 
468 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  38.35 
 
 
487 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  39.39 
 
 
438 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  35.63 
 
 
458 aa  260  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  39.19 
 
 
457 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  39.24 
 
 
458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  39.24 
 
 
458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  39.01 
 
 
457 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  38.95 
 
 
457 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  38.95 
 
 
457 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  39.01 
 
 
458 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  38.55 
 
 
505 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  38.77 
 
 
458 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  38.3 
 
 
458 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  38.72 
 
 
479 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  37.36 
 
 
458 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  35.8 
 
 
450 aa  255  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  36.49 
 
 
463 aa  255  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  37.27 
 
 
469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  38.08 
 
 
505 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  36.67 
 
 
493 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  37.62 
 
 
505 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  38.7 
 
 
462 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  38.7 
 
 
462 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  38.7 
 
 
462 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  38.7 
 
 
462 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  38.88 
 
 
465 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  38.7 
 
 
462 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  38 
 
 
503 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  37.72 
 
 
465 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  37.64 
 
 
465 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  38.7 
 
 
509 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  38.48 
 
 
462 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  37.92 
 
 
462 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  38.67 
 
 
509 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  38.67 
 
 
485 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  35.96 
 
 
460 aa  249  9e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  36.99 
 
 
440 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  36.99 
 
 
440 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  38.7 
 
 
469 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  36.99 
 
 
440 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  36.99 
 
 
440 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  36.99 
 
 
440 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  36.75 
 
 
440 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  36.99 
 
 
440 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  36.99 
 
 
440 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  36.99 
 
 
440 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  36.52 
 
 
440 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  37.07 
 
 
500 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  38.81 
 
 
463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  36.61 
 
 
501 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  37.68 
 
 
506 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>