More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2284 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  86.12 
 
 		 462 aa  795    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  89.7 
 
 		 463 aa  782    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  69.33 
 
 		 461 aa  634    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 		 466 aa  911    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  69.51 
 
 		 472 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  68.83 
 
 		 461 aa  625  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  67.18 
 
 		 463 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  67.41 
 
 		 462 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  67.18 
 
 		 463 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  67.18 
 
 		 463 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  67.18 
 
 		 463 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  67.18 
 
 		 463 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  68.82 
 
 		 466 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  67.56 
 
 		 464 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  67.56 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  67.56 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  67.56 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  67.56 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  67.56 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  67.56 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  67.34 
 
 		 463 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  67.56 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  67.34 
 
 		 463 aa  606  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  68.09 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  67.94 
 
 		 462 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  67.71 
 
 		 462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  58.13 
 
 		 453 aa  528  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  56.24 
 
 		 462 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  55.38 
 
 		 462 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  55.83 
 
 		 462 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  56.01 
 
 		 462 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  56.24 
 
 		 462 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  56.24 
 
 		 462 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  56.24 
 
 		 462 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  55.58 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  55.58 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  55.58 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  55.58 
 
 		 462 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  55.58 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  55.58 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  55.35 
 
 		 509 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  55.78 
 
 		 462 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  55.65 
 
 		 461 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  56.21 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  55.98 
 
 		 459 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  56.21 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  56.21 
 
 		 459 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  55.76 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  53.74 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  51.55 
 
 		 500 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  50.98 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  50.9 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  48.28 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  47.06 
 
 		 486 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  48.07 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  48.93 
 
 		 468 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  44.16 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  44.13 
 
 		 517 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  48.12 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  47.75 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  42.32 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  44.32 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  44.32 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  44.32 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  44.32 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  44.32 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  44.32 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  44.1 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  44.1 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  44.9 
 
 		 484 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  34.66 
 
 		 451 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  36.12 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  36.12 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  36.32 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  36.58 
 
 		 479 aa  259  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  36.23 
 
 		 449 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  37.44 
 
 		 474 aa  250  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  35.76 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  36.65 
 
 		 445 aa  243  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  34.34 
 
 		 470 aa  242  7.999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  34.34 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  34.07 
 
 		 449 aa  229  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  31.79 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  33.41 
 
 		 466 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  32.16 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  29.92 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  31.76 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  34.16 
 
 		 487 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  34.08 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  33.03 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  32.4 
 
 		 458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  33.41 
 
 		 505 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  32.2 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  33.03 
 
 		 438 aa  209  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  32.54 
 
 		 458 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  32.54 
 
 		 458 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  33.71 
 
 		 640 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  32.32 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  33.33 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  31.14 
 
 		 489 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>