More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3725 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  80.92 
 
 		 438 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 445 aa  853    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  63.45 
 
 		 449 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  48.05 
 
 		 451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  45.1 
 
 		 452 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  45.1 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  41.18 
 
 		 452 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  38.36 
 
 		 468 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  41.53 
 
 		 452 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  39.73 
 
 		 468 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  40.43 
 
 		 455 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  40.47 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  40.43 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  39.2 
 
 		 525 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  40.69 
 
 		 431 aa  280  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  41.5 
 
 		 466 aa  280  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  39.2 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  39.2 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  39.2 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  39.2 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  39.2 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  39.2 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  39.22 
 
 		 482 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  39.2 
 
 		 525 aa  279  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  37.47 
 
 		 500 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  39.56 
 
 		 468 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  37.88 
 
 		 466 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  36.59 
 
 		 462 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  38 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  40.52 
 
 		 468 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  39.23 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  38.12 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  37.64 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  38.16 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  39.23 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  38.57 
 
 		 461 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  38.05 
 
 		 465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  39.34 
 
 		 469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  39.58 
 
 		 469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  39.23 
 
 		 451 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  41.15 
 
 		 457 aa  265  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  39.04 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  39.04 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  34.73 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  40.67 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  40.67 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  40.43 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  39.76 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  38.93 
 
 		 466 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  38.6 
 
 		 465 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  38.19 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  39.18 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  39.49 
 
 		 469 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  37.47 
 
 		 487 aa  259  5.0000000000000005e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  35.67 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  36.77 
 
 		 489 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  38.27 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  36.2 
 
 		 466 aa  256  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  36.76 
 
 		 449 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  33.41 
 
 		 458 aa  256  6e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  38.04 
 
 		 458 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  38.04 
 
 		 458 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  38.04 
 
 		 458 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  37.81 
 
 		 457 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  37.33 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  39.35 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  37.61 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  37.33 
 
 		 471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  36.51 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  38.28 
 
 		 505 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  36.19 
 
 		 463 aa  253  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  39.95 
 
 		 469 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  36.76 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  37.3 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  37.3 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  37.3 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  37.3 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  37.3 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  37.3 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  37.3 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  37.3 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  37.85 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  36.09 
 
 		 457 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  36.83 
 
 		 440 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  34.84 
 
 		 450 aa  250  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  37.06 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  39.1 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  34.74 
 
 		 486 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  37.78 
 
 		 462 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  37.62 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  39.85 
 
 		 435 aa  246  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  37.8 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  37.8 
 
 		 485 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  36.38 
 
 		 503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  37.59 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  37.8 
 
 		 509 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  37.33 
 
 		 462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  39.31 
 
 		 505 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  37.33 
 
 		 462 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  37.33 
 
 		 462 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>