More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001868 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  86.12 
 
 
466 aa  795    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 
462 aa  903    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  92.44 
 
 
463 aa  825    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  68.47 
 
 
472 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  68.47 
 
 
461 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  67.79 
 
 
461 aa  620  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  65.99 
 
 
462 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  65.25 
 
 
463 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  65.25 
 
 
463 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  65.25 
 
 
463 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  65.25 
 
 
463 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  65.25 
 
 
463 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  66.3 
 
 
466 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  64.72 
 
 
464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  65.4 
 
 
463 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  65.62 
 
 
463 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  65.62 
 
 
463 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  65.62 
 
 
463 aa  597  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  66.97 
 
 
462 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  66.67 
 
 
462 aa  595  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  65.62 
 
 
463 aa  597  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  65.62 
 
 
463 aa  597  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  65.4 
 
 
463 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  65.62 
 
 
463 aa  597  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  65.62 
 
 
463 aa  597  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  66.59 
 
 
462 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  57.11 
 
 
453 aa  513  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  53.93 
 
 
462 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  53.71 
 
 
462 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  53.71 
 
 
462 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  53.71 
 
 
462 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  53.71 
 
 
462 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  53.48 
 
 
462 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  53.48 
 
 
462 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  53.03 
 
 
462 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  53.03 
 
 
462 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  53.03 
 
 
462 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  53.03 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  53.03 
 
 
462 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  53.03 
 
 
462 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  52.81 
 
 
509 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  53.26 
 
 
462 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  52.98 
 
 
461 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  53.69 
 
 
461 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  53.93 
 
 
459 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  54.38 
 
 
459 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  53.71 
 
 
459 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  53.26 
 
 
459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  54.98 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  50.98 
 
 
458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  49.46 
 
 
488 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  49.12 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  47.07 
 
 
486 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  48.45 
 
 
468 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  48.42 
 
 
465 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  46.96 
 
 
465 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  46.15 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  47.32 
 
 
468 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  44.64 
 
 
517 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  43.05 
 
 
452 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  47.28 
 
 
434 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  44.37 
 
 
466 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  44.59 
 
 
466 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  44.59 
 
 
466 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  44.59 
 
 
466 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  44.37 
 
 
466 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  44.59 
 
 
466 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  44.59 
 
 
466 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  44.59 
 
 
466 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  43.04 
 
 
484 aa  364  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  35.92 
 
 
451 aa  299  8e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  36.58 
 
 
452 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  36.58 
 
 
452 aa  282  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  36.5 
 
 
438 aa  273  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  37.91 
 
 
449 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  36.84 
 
 
479 aa  262  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  36.59 
 
 
445 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  35.75 
 
 
461 aa  256  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  36.19 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  35.96 
 
 
474 aa  250  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  34.42 
 
 
478 aa  242  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  32.05 
 
 
450 aa  240  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  33.92 
 
 
466 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  33.62 
 
 
449 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  31.38 
 
 
465 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  34.6 
 
 
500 aa  220  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  34.68 
 
 
501 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  32.2 
 
 
487 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  32.89 
 
 
505 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  32.79 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  32.79 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  32.5 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  30.91 
 
 
489 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  32.05 
 
 
440 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  31.82 
 
 
440 aa  212  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  31.82 
 
 
440 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  32.43 
 
 
440 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  32.43 
 
 
440 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  32.43 
 
 
440 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  32.43 
 
 
440 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>