More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1007 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  90.69 
 
 
462 aa  803    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  82.08 
 
 
459 aa  717    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  96.32 
 
 
462 aa  866    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  89.83 
 
 
462 aa  817    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  82.3 
 
 
459 aa  719    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  96.32 
 
 
462 aa  866    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  82.3 
 
 
459 aa  720    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  96.32 
 
 
509 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  91.13 
 
 
462 aa  828    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  100 
 
 
462 aa  895    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  82.74 
 
 
459 aa  720    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  91.99 
 
 
462 aa  833    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  96.32 
 
 
462 aa  866    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  96.32 
 
 
462 aa  866    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  89.61 
 
 
462 aa  815    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  83 
 
 
461 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  91.99 
 
 
462 aa  833    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  91.99 
 
 
462 aa  833    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  96.54 
 
 
462 aa  867    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  82.77 
 
 
461 aa  719    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  96.32 
 
 
462 aa  866    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  56.01 
 
 
466 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  53.71 
 
 
462 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  54.29 
 
 
463 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  54.29 
 
 
463 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  54.29 
 
 
463 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  54.29 
 
 
463 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  53.68 
 
 
461 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  54.29 
 
 
463 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  55.2 
 
 
472 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  53.78 
 
 
463 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  54.71 
 
 
461 aa  481  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  54.73 
 
 
462 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  54.26 
 
 
464 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  55.65 
 
 
462 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  55.43 
 
 
466 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  55.2 
 
 
463 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  55.2 
 
 
463 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  55.2 
 
 
463 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  55.2 
 
 
463 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  55.2 
 
 
463 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  55.2 
 
 
463 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  55.2 
 
 
463 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  54.98 
 
 
463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  54.98 
 
 
463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  54.44 
 
 
462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  54.67 
 
 
462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  50.34 
 
 
453 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  50 
 
 
488 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  49.67 
 
 
445 aa  421  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  49.32 
 
 
500 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  49.45 
 
 
468 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  45.54 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  49.11 
 
 
458 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  48.19 
 
 
465 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  46.76 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  46.03 
 
 
486 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  48.33 
 
 
468 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  47.05 
 
 
517 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  44.17 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  46.26 
 
 
434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  44.17 
 
 
466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  44.17 
 
 
466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  44.17 
 
 
466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  44.17 
 
 
466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  44.17 
 
 
466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  43.95 
 
 
466 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  43.95 
 
 
466 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  44.52 
 
 
484 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  39.51 
 
 
452 aa  323  4e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  39.32 
 
 
451 aa  286  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  38.04 
 
 
449 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  37.05 
 
 
452 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  37.05 
 
 
452 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  37.92 
 
 
438 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  36.48 
 
 
470 aa  249  8e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  34.67 
 
 
461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  37.78 
 
 
445 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  31.1 
 
 
450 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  34.37 
 
 
479 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  33.56 
 
 
474 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  31.67 
 
 
458 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  35.81 
 
 
455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  33.99 
 
 
466 aa  217  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  36.26 
 
 
451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  36.03 
 
 
451 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  34.8 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  35.12 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  32.9 
 
 
478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  36.28 
 
 
438 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  32.17 
 
 
440 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  35.57 
 
 
451 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  35.57 
 
 
451 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34046  Uric acid-xanthine permease (UAPA transporter)  33.33 
 
 
590 aa  208  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.219195  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  36.45 
 
 
435 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  32.63 
 
 
440 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  32.63 
 
 
440 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  33.57 
 
 
442 aa  207  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  35.73 
 
 
452 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  32.63 
 
 
440 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>