More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0772 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 		 465 aa  915    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  94.62 
 
 		 465 aa  874    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  75.8 
 
 		 468 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  72.43 
 
 		 458 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  76.02 
 
 		 468 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  71.43 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  55.27 
 
 		 486 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  56.04 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  55.97 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  53.65 
 
 		 468 aa  494  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  51.41 
 
 		 517 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  48.28 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  48.42 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  48.28 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  48 
 
 		 461 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  47.88 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  47.78 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  47.88 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  47.88 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  47.24 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  47.88 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  47.88 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  47.88 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  47.39 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  47.44 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  46.37 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  47.74 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  47.39 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  47.39 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  46.76 
 
 		 462 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  45.86 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  47.44 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  47.44 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  47.44 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  46.76 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  47.44 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  47.44 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  46.52 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  47.44 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  47.44 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  46.52 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  46.52 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  47.22 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  46.52 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  46.52 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  45.64 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  46.52 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  46.29 
 
 		 509 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  46.98 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  47.09 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  47.64 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  46.53 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  46.76 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  47.06 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  46.83 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  46.83 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  46.61 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  47.32 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  47.19 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  47.44 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  43.21 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  44.99 
 
 		 466 aa  351  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  44.99 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  44.99 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  44.99 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  44.99 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  44.99 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  44.77 
 
 		 466 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  44.77 
 
 		 466 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  42.57 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  37.5 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  37.06 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  34.49 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  37.72 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  34.27 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  38.88 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  34.3 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  37.33 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  35.01 
 
 		 479 aa  230  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  33.47 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  37.88 
 
 		 435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  33.11 
 
 		 440 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  34.32 
 
 		 440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  34.32 
 
 		 440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  33.33 
 
 		 440 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  33.55 
 
 		 440 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  33.33 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  34.32 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  34.32 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  34.32 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  34.32 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  34.32 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  32.64 
 
 		 487 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  34.07 
 
 		 466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  34.3 
 
 		 478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  33.19 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  29.83 
 
 		 450 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  32.96 
 
 		 466 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  32.78 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  33.26 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>