More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4214 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  86.55 
 
 		 472 aa  786    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  86.12 
 
 		 461 aa  781    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  85.87 
 
 		 463 aa  772    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  85.87 
 
 		 463 aa  772    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  86.84 
 
 		 463 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  98.05 
 
 		 462 aa  898    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  85.87 
 
 		 463 aa  772    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  89.78 
 
 		 462 aa  820    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  85.87 
 
 		 463 aa  772    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  91.3 
 
 		 462 aa  808    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 462 aa  917    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  86.9 
 
 		 464 aa  790    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  86.55 
 
 		 461 aa  788    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  85.87 
 
 		 463 aa  772    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  85.87 
 
 		 463 aa  772    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  85.87 
 
 		 463 aa  772    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  85.65 
 
 		 463 aa  771    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  86.84 
 
 		 463 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  89.6 
 
 		 466 aa  785    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  85.65 
 
 		 463 aa  770    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  86.84 
 
 		 463 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  86.84 
 
 		 463 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  86.84 
 
 		 463 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  67.94 
 
 		 466 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  66.97 
 
 		 462 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  67.66 
 
 		 463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  66.59 
 
 		 453 aa  587  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  54.44 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  53.78 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  53.78 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  53.73 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  54.55 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  53.48 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  53.48 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  53.51 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  53.48 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  53.78 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  53.78 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  53.78 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  53.78 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  53.56 
 
 		 509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  54.87 
 
 		 461 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  54.47 
 
 		 459 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  54.85 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  54.25 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  53.26 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  54.47 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  54.03 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  46.93 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  47.48 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  48.1 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  45.52 
 
 		 486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  46.76 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  46.53 
 
 		 465 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  45.23 
 
 		 488 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  47.75 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  45.68 
 
 		 517 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  46.53 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  46.24 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  42.4 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  42.03 
 
 		 452 aa  358  8e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  45.68 
 
 		 466 aa  356  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  45.68 
 
 		 466 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  45.68 
 
 		 466 aa  356  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  45.68 
 
 		 466 aa  356  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  45.68 
 
 		 466 aa  356  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  45.45 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  45.45 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  45.45 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  44.37 
 
 		 484 aa  345  8.999999999999999e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  36.43 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  37.33 
 
 		 449 aa  253  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  35.37 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  34.69 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  35.51 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  35.36 
 
 		 438 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  36.43 
 
 		 474 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  34.22 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  34.3 
 
 		 478 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  36.63 
 
 		 461 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  35.75 
 
 		 445 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  31.87 
 
 		 825 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  29.81 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  30.75 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  34.6 
 
 		 505 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  32.95 
 
 		 431 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  32.65 
 
 		 438 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  33.63 
 
 		 466 aa  206  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  34.36 
 
 		 505 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  32.86 
 
 		 458 aa  204  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  33.89 
 
 		 505 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  29.3 
 
 		 465 aa  203  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  34.16 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  32.51 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2645  uracil-xanthine permease  31.02 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  33.89 
 
 		 505 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  31.39 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  31.6 
 
 		 442 aa  199  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  33.94 
 
 		 501 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  32.44 
 
 		 503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>