More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0538 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  100 
 
 		 453 aa  887    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  67.41 
 
 		 464 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  66.52 
 
 		 463 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  66.52 
 
 		 463 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  65.7 
 
 		 461 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  65.7 
 
 		 472 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  66.52 
 
 		 463 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  66.52 
 
 		 463 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  66.52 
 
 		 463 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  66.29 
 
 		 462 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  65.48 
 
 		 461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  66.22 
 
 		 463 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  66.22 
 
 		 463 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  66.22 
 
 		 463 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  66.59 
 
 		 462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  66.22 
 
 		 463 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  66.22 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  66.22 
 
 		 463 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  65.19 
 
 		 466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  66.22 
 
 		 463 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  66.22 
 
 		 463 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  66.22 
 
 		 462 aa  571  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  66 
 
 		 463 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  66.07 
 
 		 462 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  58.13 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  57.11 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  57.44 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  50.34 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  49.66 
 
 		 462 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  49.44 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  49.44 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  49.44 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  49.44 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  49.44 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  49.44 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  49.44 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  49.44 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  49.44 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  49.44 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  49.44 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  49.21 
 
 		 509 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  48.99 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  50.22 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  49.55 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  48.31 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  48.53 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  48.63 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  48.63 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  45.62 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  45.02 
 
 		 468 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  46.8 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  44.04 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  44 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  42.09 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  43.21 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  43.31 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  41.78 
 
 		 517 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  41.24 
 
 		 488 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  42.83 
 
 		 466 aa  353  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  42.83 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  42.83 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  42.83 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  42.83 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  42.83 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  42.6 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  42.6 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  42.92 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  40.13 
 
 		 452 aa  339  7e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  40.22 
 
 		 484 aa  326  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  42.02 
 
 		 434 aa  325  9e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  35.23 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  35.23 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  32.44 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  33.77 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  34.8 
 
 		 449 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  34.44 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  33.78 
 
 		 479 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  33.94 
 
 		 474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  33.48 
 
 		 478 aa  227  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  29.85 
 
 		 450 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  32.29 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  35.48 
 
 		 505 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  34.09 
 
 		 503 aa  223  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  32.58 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  31.44 
 
 		 465 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  32.31 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  35.95 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  33.02 
 
 		 431 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  34.19 
 
 		 501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  35.48 
 
 		 505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  30.24 
 
 		 458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  35.24 
 
 		 505 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  33.81 
 
 		 485 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  33.57 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  34.52 
 
 		 497 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  34.05 
 
 		 506 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  31.04 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  33.41 
 
 		 496 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  33.18 
 
 		 566 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34046  Uric acid-xanthine permease (UAPA transporter)  29.66 
 
 		 590 aa  202  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.219195  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>