More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2309 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 237 aa  470  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  65.16 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  64.16 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  64.98 
 
 		 232 aa  288  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  63.27 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  63.27 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  63.27 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  63.51 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  62.1 
 
 		 246 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  62.72 
 
 		 249 aa  278  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  61.84 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  59.47 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  63.64 
 
 		 227 aa  275  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  60.34 
 
 		 246 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  61.78 
 
 		 251 aa  274  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  60.09 
 
 		 250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  61.06 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  61.06 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  61.06 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  63.89 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  61.47 
 
 		 227 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  61.47 
 
 		 227 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  59.45 
 
 		 228 aa  264  7e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  57.66 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  58.06 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  61.93 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  59.73 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  61.01 
 
 		 228 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  58.64 
 
 		 224 aa  261  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  61.01 
 
 		 228 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  61.01 
 
 		 227 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  55.56 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  59.91 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  62.21 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  56.56 
 
 		 235 aa  254  7e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.09 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  55.91 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.09 
 
 		 228 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  59.09 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  57.8 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  57.27 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  61.93 
 
 		 227 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  60.55 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  61.01 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  61.01 
 
 		 227 aa  248  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  58.06 
 
 		 224 aa  248  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  57.53 
 
 		 233 aa  248  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  55.86 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  56.88 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  55.71 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  56.22 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  55.86 
 
 		 243 aa  245  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  55.96 
 
 		 250 aa  245  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  55.96 
 
 		 242 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  56.82 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  55.3 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.41 
 
 		 228 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  56.68 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  55.41 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.41 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  55.41 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.41 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  55.41 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  57.14 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.41 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.41 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  56.82 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.41 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  61.47 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.86 
 
 		 228 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 		 226 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  54.95 
 
 		 243 aa  242  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  59.45 
 
 		 239 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.86 
 
 		 228 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  54.75 
 
 		 239 aa  241  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  55.91 
 
 		 228 aa  241  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.86 
 
 		 228 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.86 
 
 		 228 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  54.38 
 
 		 240 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  55.86 
 
 		 228 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  59.7 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  56.36 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  54.84 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  54.95 
 
 		 228 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  56.22 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  53 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  56.36 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  57.29 
 
 		 200 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  56.82 
 
 		 233 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  52.65 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1385  ABC transporter related  56.62 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00534091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>