More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1707 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  100 
 
 		 611 aa  1259    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  57.7 
 
 		 602 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  56.01 
 
 		 623 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  56.89 
 
 		 602 aa  710    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  56.89 
 
 		 602 aa  710    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  55.83 
 
 		 609 aa  710    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  58.44 
 
 		 624 aa  743    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  57.87 
 
 		 602 aa  728    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  55.41 
 
 		 600 aa  695    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  60.69 
 
 		 616 aa  776    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  57.21 
 
 		 602 aa  721    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  57.54 
 
 		 602 aa  724    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  55.12 
 
 		 610 aa  687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  57.54 
 
 		 602 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  56.44 
 
 		 606 aa  714    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  54.52 
 
 		 606 aa  680    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  57.83 
 
 		 613 aa  744    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  56.89 
 
 		 602 aa  709    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  56.89 
 
 		 602 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  55.94 
 
 		 611 aa  700    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  27.63 
 
 		 621 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.95 
 
 		 614 aa  76.3  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.4 
 
 		 746 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  27.35 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3364  serine/threonine protein kinase  27 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 		 642 aa  73.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.07 
 
 		 662 aa  73.6  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  28.12 
 
 		 604 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  26.58 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  26.61 
 
 		 781 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3751  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 478 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000729349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 		 505 aa  70.5  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 		 842 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 422 aa  69.7  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.37 
 
 		 2051 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.11 
 
 		 627 aa  67.8  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.26 
 
 		 850 aa  67.8  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.82 
 
 		 1797 aa  67.4  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 		 752 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5424  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 518 aa  67  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178925  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 466 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 		 985 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 		 776 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.01 
 
 		 806 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  27.67 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  26.36 
 
 		 666 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  30.54 
 
 		 762 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.64 
 
 		 715 aa  65.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  26.81 
 
 		 1850 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  25.29 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 		 866 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  23.78 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2673  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0573698  normal  0.794147 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  26.24 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 		 625 aa  65.1  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1579  serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  25.3 
 
 		 891 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  25.28 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  28 
 
 		 774 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 		 894 aa  63.9  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 		 526 aa  63.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 599 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  26.18 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.07 
 
 		 520 aa  63.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  26.24 
 
 		 666 aa  63.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 509 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  26.36 
 
 		 625 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3164  serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 		 682 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00493454  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  29.89 
 
 		 637 aa  62.4  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.52 
 
 		 798 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1760  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.12 
 
 		 1023 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.05 
 
 		 1780 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  22.92 
 
 		 692 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  27.39 
 
 		 596 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0235  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 590 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 777 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 		 651 aa  62  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  23.92 
 
 		 457 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 		 612 aa  62  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>