More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2462 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  99.42 
 
 		 347 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  100 
 
 		 347 aa  707    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  71.01 
 
 		 345 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  57.01 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  54.65 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  54.87 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  53.03 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  52.49 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  55.06 
 
 		 348 aa  359  4e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  56.39 
 
 		 348 aa  359  5e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  49.26 
 
 		 341 aa  342  7e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  49.85 
 
 		 354 aa  339  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  51.64 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  51.65 
 
 		 350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  50.76 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  48.75 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  47.8 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  49.37 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  46.25 
 
 		 345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  47.11 
 
 		 348 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  46.36 
 
 		 372 aa  299  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  46.27 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  46.98 
 
 		 356 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  49.69 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  45.95 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  48.63 
 
 		 352 aa  278  7e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  40.27 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  42.33 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  45.76 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  43.3 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  42.61 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  46.8 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  43.33 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  40.06 
 
 		 351 aa  236  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  40.48 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  39.8 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  39.46 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  42.5 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  32.88 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  32.98 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  29.26 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  28.89 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.48 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.86 
 
 		 473 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  28.52 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2187  biotin synthase  27.46 
 
 		 367 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  27.84 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.77 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.76 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  26.23 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  28.48 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  27.07 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.82 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.08 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.08 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  26.54 
 
 		 475 aa  82.8  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  27.81 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  25.24 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.1 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  27.03 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.35 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  31.34 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  25.26 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.8 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.89 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1861  putative biotin synthase  27.08 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.8 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  25.5 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  29.41 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  24.56 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2150  biotin synthase  27.08 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.12 
 
 		 458 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  25.44 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  25.44 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.32 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  24.91 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  23.61 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  28.37 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.97 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.69 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.77 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  28.01 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  24.31 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  23.96 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.45 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  23.71 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.89 
 
 		 473 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  26.79 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  23.37 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  26.48 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  22.84 
 
 		 388 aa  75.9  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  26.48 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  25.28 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  23.16 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  23.71 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  23.34 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0246  biotin synthase  23.7 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.71 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>