More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1377 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  98.8 
 
 		 250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  74.9 
 
 		 250 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  72.06 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  69.51 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  71.26 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  69.76 
 
 		 252 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  68.95 
 
 		 252 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  68.95 
 
 		 252 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  68.95 
 
 		 252 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  69.35 
 
 		 252 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  68.55 
 
 		 252 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  68.55 
 
 		 252 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  66.94 
 
 		 252 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  68.95 
 
 		 251 aa  363  1e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  65.34 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  65.2 
 
 		 257 aa  345  5e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  64 
 
 		 249 aa  342  4e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  62.4 
 
 		 249 aa  341  5.999999999999999e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  62.55 
 
 		 259 aa  341  8e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  63.05 
 
 		 249 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  59.69 
 
 		 262 aa  337  9.999999999999999e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  61.45 
 
 		 252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  53.52 
 
 		 285 aa  316  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  58.57 
 
 		 253 aa  295  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  51.61 
 
 		 253 aa  293  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  53.04 
 
 		 268 aa  287  9e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  54.22 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  52.19 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.21 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  48.61 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  49.8 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  48.22 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  47.41 
 
 		 336 aa  245  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  48.06 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  48.21 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  46.69 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  45.02 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  47.22 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  43.31 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  46.46 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  43.78 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  44.4 
 
 		 272 aa  221  7e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  44.62 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  43.82 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  46.64 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  45.67 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  46.85 
 
 		 252 aa  215  7e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  43.87 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  42.17 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  42.29 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  43.65 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  42.52 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  41.34 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  46.22 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  43.91 
 
 		 275 aa  209  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  41.11 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  43.43 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  42.46 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.88 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  42.06 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  41.13 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  43.8 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  42.18 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  41.91 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  43.19 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  39.15 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  39.15 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  43.12 
 
 		 274 aa  201  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  42.35 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.31 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  42.86 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  40.39 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  41.6 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  38.65 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  38.65 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  39.29 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  37.45 
 
 		 257 aa  191  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  38.58 
 
 		 259 aa  191  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  42.13 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  42.52 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  38.58 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  42.96 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  38.65 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  38.34 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.08 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  39.44 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  37.85 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  37.45 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  37.45 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  37.45 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  37.45 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  37.45 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  37.45 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  37.45 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  40.16 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  40.16 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  39.13 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>