More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0340 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  100 
 
 		 487 aa  984    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  98.97 
 
 		 487 aa  976    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  41.24 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  37.01 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  36.36 
 
 		 461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 		 473 aa  280  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.92 
 
 		 504 aa  272  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  34.16 
 
 		 972 aa  259  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 		 478 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  36 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 		 503 aa  251  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 		 924 aa  245  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.06 
 
 		 476 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  34.13 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 		 472 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 487 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  32.19 
 
 		 933 aa  227  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 482 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  33.66 
 
 		 485 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 493 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 		 483 aa  223  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.74 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  31.9 
 
 		 921 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 		 485 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.61 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.06 
 
 		 488 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 		 573 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 		 547 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 		 484 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 483 aa  203  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  33.2 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  33.06 
 
 		 489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 		 501 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 		 577 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 		 493 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.25 
 
 		 491 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 491 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 491 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 491 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  32.63 
 
 		 578 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  33.27 
 
 		 488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  31.6 
 
 		 574 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 642 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  30.99 
 
 		 495 aa  187  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 		 603 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  32.3 
 
 		 579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.78 
 
 		 491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  32 
 
 		 490 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.5 
 
 		 645 aa  183  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  31.59 
 
 		 503 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.73 
 
 		 954 aa  181  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  29.98 
 
 		 626 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.41 
 
 		 481 aa  181  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  29.74 
 
 		 570 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  32.53 
 
 		 636 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.37 
 
 		 647 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 		 634 aa  177  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  30 
 
 		 596 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  32.58 
 
 		 646 aa  177  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  33.03 
 
 		 598 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  30.02 
 
 		 640 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 		 643 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 		 597 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  32.45 
 
 		 612 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  32.45 
 
 		 612 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  29.91 
 
 		 639 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.11 
 
 		 645 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 		 609 aa  173  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 		 636 aa  173  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  29.8 
 
 		 610 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  32.45 
 
 		 613 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 610 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  30.12 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  32.13 
 
 		 535 aa  171  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 		 673 aa  170  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 		 631 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  30.91 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  32.54 
 
 		 488 aa  167  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.64 
 
 		 629 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 		 618 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  29.25 
 
 		 504 aa  166  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  31.77 
 
 		 775 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  30.57 
 
 		 800 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 		 486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 		 761 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 		 629 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.97 
 
 		 771 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  30 
 
 		 641 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 		 629 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  29.32 
 
 		 765 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.32 
 
 		 765 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  31.45 
 
 		 629 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  29.32 
 
 		 760 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.54 
 
 		 646 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>